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stringr是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分Day7的讲到的一个重要知识点。为加深理解,现在找个数据做下练习巩固。首先学习下这个函数,然后再开始练习。
stringr常用函数介绍
stringr包常用的字符串的处理以str_开头来命名,方便更直观理解函数的定义。我们可以根据使用习惯对函数进行分类:
字符串拼接函数
str_c: 字符串拼接。
str_join: 字符串拼接,同str_c。
str_trim: 去掉字符串的空格和TAB(\t)
str_pad: 补充字符串的长度
str_dup: 复制字符串
str_wrap: 控制字符串输出格式
str_sub: 截取字符串
str_sub
字符串计算函数
str_count: 字符串计数
str_length: 字符串长度
str_sort: 字符串值排序
str_order: 字符串索引排序,规则同str_sort
字符串匹配函数
str_split: 字符串分割
str_split_fixed: 字符串分割,同str_split
str_subset: 返回匹配的字符串
word: 从文本中提取单词
str_detect: 检查匹配字符串的字符
str_match: 从字符串中提取匹配组。
str_match_all: 从字符串中提取匹配组,同str_match
str_replace: 字符串替换
str_replace_all: 字符串替换,同str_replace
str_replace_na:把NA替换为NA字符串
str_locate: 找到匹配的字符串的位置。
str_locate_all: 找到匹配的字符串的位置,同str_locate
str_extract: 从字符串中提取匹配字符
str_extract_all: 从字符串中提取匹配字符,同str_extract
字符串变换函数
str_conv: 字符编码转换
str_to_upper: 字符串转成大写
str_to_lower: 字符串转成小写,规则同str_to_upper
str_to_title: 字符串转成首字母大写,规则同str_to_upper
参数控制函数,仅用于构造功能的参数,不能独立使用。
boundary: 定义使用边界
coll: 定义字符串标准排序规则。
fixed: 定义用于匹配的字符,包括正则表达式中的转义符
regex: 定义正则表达式
stringr安装及生成测试数据
> install.packages('stringr')
> library(stringr)
> x
> x
[1] "The two met while playing on the sand."
1.首先检测变量x中有多少个元素
> length(x)#元素 是只有一个元素的句子
[1] 1
2.检测x中有多少个字符
> str_count(x)
[1] 38
> str_length(x)
[1] 38
> nchar(x)#基础函数
[1] 38
> #统计下x中空格个个数
> str_count(x," ")
[1] 7
> #统计下x中o的个数
> str_count(x2,"o")
[1] 0 1 0 0 0 1 0 0
3.检测x中多少个字母
> #去除点和空格就是字母数。可以看出统计字符是包含空格和标点在内的
> str_count(x)-str_count(x,' ')-str_count(x,'[.]')
[1] 30
> str_count(x)-str_count(x,' ')-str_count(x,'\\.')
[1] 30
> #这里要注意的是‘.’,需要用转义符号\\或[]来实现它本来的意思。
> #具体可以搜索正则表达式。
4.字符串拆分
> #将x按照空格拆分成多个元素
> str_split(x," ")
[[1]]
[1] "The" "two" "met" "while" "playing" "on" "the" "sand."
> #可以看出这是一个只有一个元素的列表
> class(str_split(x," "))
[1] "list"
> #提取列表第一个元素
> x2 = str_split(x," ")[[1]]
> x2
[1] "The" "two" "met" "while" "playing" "on" "the" "sand."
5 字符串组合
#将x2 按照空格分割符组合成一个元素
> str_c(x2,collapse = " ")
[1] "The two met while playing on the sand."
> #将x2每个元素都加上.1的后缀
> str_c(x2,1,sep = ".")#元素内联
[1] "The.1" "two.1" "met.1" "while.1" "playing.1" "on.1"
[7] "the.1" "sand..1"
6.提取x的第5到8个元素
> str_sub(x,5,8)
[1] "two "
7.大小写转换
> #将x2全部转换为大写
> str_to_upper(x2)
[1] "THE" "TWO" "MET" "WHILE" "PLAYING" "ON" "THE" "SAND."
> #将x2全部转换为小写
> str_to_lower(x2)
[1] "the" "two" "met" "while" "playing" "on" "the" "sand."
> #将x2全部转化为首字母大写
> str_to_title(x2)#
[1] "The" "Two" "Met" "While" "Playing" "On" "The" "Sand."
>
8.将字符串x2按照首字母顺序进行排序
str_sort(x2)
[1] "met" "on" "playing" "sand." "the" "The" "two" "while"
>
9.字符检测
#判断x2中每个元素是否含有字母h
> str_detect(x2,"h")#重点中重点 得到逻辑值向量 取子集
[1] TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE
> #判断x2中有没有以T开头的元素
> str_starts(x2,"T")
[1] TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
> #判断x2中有没有以e结尾的元素
> str_ends(x2,"e")#开头结尾
[1] TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE TRUE FALSE
> #提取x2中以T开头的元素
> x2[str_starts(x2,"T")]
[1] "The"
> ###与sum和mean连用,可以统计匹配的个数和比例
> sum(str_detect(x2,"h"))
[1] 3
> mean(str_detect(x2,"h"))
[1] 0.375
> as.numeric(str_detect(x2,"h"))
[1] 1 0 0 1 0 0 1 0
10.提取匹配到的字符串或字符串替换
#提取x2中含有h的元素
> str_subset(x2,"h")
[1] "The" "while" "the"
> #将x2中所有o替换为2021
> str_replace(x2,"o","2021")#
[1] "The" "tw2021" "met" "while" "playing" "2021n" "the" "sand."
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