散点图绘制三维曲面_PCA、RDA等排序图的一些三维可视化示例

作者：IT小白 | 2024-03-20 04:12:10

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dca排序图

列举几种绘制三维散点图的R包

前文已分享了PCA 、CA 、DCA 、PCoA 、NMDS 、RDA 、db-RDA (CAP)、CCA 等排序方法在R语言中的计算过程。同时在分享过程中，每篇都对应了1-2例排序图作图示例，帮助大家掌握排序图的绘制方法。但是这些示例中所展示的基本都是二维散点图，毕竟在实际中，大多数情况下有意义的都是前两轴。但偶尔也会关注第三轴，归因于它具有可观的贡献度或者明显的排布特征。本篇列举几种常用的绘制三维散点图的 R 包，实际情况中结合帮助文档调试参数使用，或再配合 AI 、 PS 等修图工具，可视化三轴的排序图。本篇主要以某 PCA 的结果为例绘图展示。示例文件、 R 脚本等的百度盘链接： https://pan.baidu.com/s/1KUA5owf4y13y1RJbff-l7g “ pca_site.txt ”是某 PCA 分析的样方(对象)排序坐标，“ pca_var.txt ”是变量的坐标。

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