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大规模底库搜索特征比对库Milvus(二),使用 , 减少reid评估时间_milvusclient.flush

milvusclient.flush
1.1、安装问题1

Milvus0.6版本安装使用教程

Milvus 0.8 开源向量搜索引擎使用教程

官网各种版本选择链接,选择最新的安装

版本很多,小伙伴门安装最新的,2020/7月现在是0.10.1,根据教程安装即可,教程都是中文,很友好了。
在这里插入图片描述

1.2、安装过程2

ubutn16安装过后,可以正常安装
但是跑例子时候,会报错(不知道是否是不同的系统导致,安装教程中是推荐ubuntu18,)

Milvus 避坑攻略
以上是开发者写的注意事项

milvus.client.exceptions.NotConnectError: Fail connecting to server on 127.0.0.1:19530. Timeout
所以下面再容器内部,手动开启一下server ,就可以跑例子了

在这里插入图片描述
Docker 19.03,增加了对–gpus选项的支持,不要用低版本

2 使用

零基础实战行人重识别ReID项目-基于Milvus的以图搜图
官方网站
在这里插入图片描述

2.1 example.py 的测试代码中的参数设置问题

如何设置 Milvus 客户端参数

在这里插入图片描述
1、IVFLAT 和 SQ8 索引都是通过聚类算法把大量的向量划分成很多‘簇’(也可以叫‘桶’)

IVFLAT 和 SQ8( ivfsq8)前者是4个字节表示一个浮点数,后者是一个字节表示浮点数,所以占用内存更少但是精度会有一点损失,更适合超大规模数据评估。ivfsq8的搜索速度没有ivflat快,因为它涉及到一次解码操作,sq8搜索的时候需要把每一个维度上的uint8还原成float数,所以会需要一部分时间(具体细节可以和作者沟通)

2、index_file_size=1024 对精度没有影响,对速度有影响
例如 2.5个G的数据 会分割成为2个 segment,每个segment 1024的容量,
然后会为每个segment 建立例如SQ8索引,剩下0.5G不够1024容量,不会建立索引index,所以这部分会慢一点。
实际操作是可以手动建立一个不足 index_file_size容量的索引,加快处理速度

3、nlist 和 nprobe 对精度有影响

1024/32 =nlist/nprobe 表示为每一个segment,建立1024个聚类中心,选择距离最近的32个中心,进行搜索,剩下的会丢弃,所以会有精度的损失,如果想要遍历所有底库数据,那么nprobe==nlist,这时候也是精度最准确(遍历了所有底库数据),耗时最高的方式, 作者实验文档中,有各种测试的精度差异,根据此来选择一个最合适的时间和精度测试

2.2 修改例子,进行reid 的rank map 测试,减少评估时间

但是没有 rerank 的过程,以下是余弦距离搜索过程,根据官方提供的接口

status, ids = milvus.insert(collection_name=collection_name, records=vectors,ids =vector_ids )
一次加载不超过256M大小,所以循环调用这句话, id不重复,加载大量数据
输入特征向量改成自己模型的输出向量(都需要做归一化)
如果查询很大集也很大,分批次search 统计结果
status, results = milvus.search(**param)

github example.py 接口使用范例

# This program demos how to connect to Milvus vector database,
# create a vector collection,
# insert 10 vectors,
# and execute a vector similarity search.

import random
import numpy as np
from sklearn import preprocessing
from milvus import Milvus, IndexType, MetricType, Status
import time
# Milvus server IP address and port.
# You may need to change _HOST and _PORT accordingly.
_HOST = '127.0.0.1'
_PORT = '19530'  # default value
# _PORT = '19121'  # default http value

# Vector parameters
_DIM = 2048  # dimension of vector
_INDEX_FILE_SIZE = 32  # max file size of stored index
# create index of vectors, search more rapidly
index_param = {
    'nlist': 2048
}

def load_gallery_feat(milvus,collection_name):
    t1=time.time()
    vectors = np.random.rand(5000, _DIM).astype(np.float32)
    vectors = preprocessing.normalize(vectors)

    # Insert vectors into demo_collection, return status and vectors id list
    vector_ids = [id for id in range(5000)]
    status, ids = milvus.insert(collection_name=collection_name, records=vectors,ids =vector_ids ) #一次数据不超过256M, 2048*4*1000
    vectors = np.random.rand(5000, _DIM).astype(np.float32)
    vectors = preprocessing.normalize(vectors)

    # Insert vectors into demo_collection, return status and vectors id list
    vector_ids = [id for id in range(5000,10000)]
    status, ids = milvus.insert(collection_name=collection_name, records=vectors,ids =vector_ids ) #一次数据不超过256M,太大报错写个for循环
    print("********************加载底库数据时间***************")
    print(time.time()-t1)
    if not status.OK():
        print("Insert failed: {}".format(status))
    # Flush collection  inserted data to disk.
    milvus.flush([collection_name])
    # Get demo_collection row count
    status, result = milvus.count_entities(collection_name)

    # present collection statistics info
    _, info = milvus.get_collection_stats(collection_name)
    # print(info)

    # Obtain raw vectors by providing vector ids
    status, result_vectors = milvus.get_entity_by_id(collection_name, ids[:10])

def map_top_test(milvus,collection_name,query_ids,query_vectors,query_camids):
    '''

    :param milvus: 调用库接口名字
    :param collection_name:
    :param query_ids:  一维列表
    :param query_vectors:  二维向量
    :return: map@topk  rank
    '''
    # execute vector similarity search
    search_param = {
        "nprobe": 16
    }
    print("Searching ... ")


    top_k = 100
    n=50 #一次搜索n张查询图片
    interval= len(query_vectors)//n  +1  #分批次处理,一次处理5000个查询图片

    all_AP = []
    rank = []
    # 因为计算容量问题,分批次搜索,
    for i in range(interval):
        if i==interval-1: #没有整除的间隔, 当前到最后剩下的向量
            query_vectors[(n * i):]
        else:
            query_vectors[(n*i):(n*(i+1))]

        param = {
            'collection_name': collection_name,
            'query_records': query_vectors,
            'top_k': top_k,
            'params': search_param,
        }
        status, results = milvus.search(**param)  #调用搜索接口,返回排序后的 id 和 距离值

        '''
        返回result格式  表示每张张图片有top2个结果返回
        [
            [
            (id:5424, distance:0.7716852426528931),
            (id:6754, distance:0.7707215547561646)
            ],
            
            [
            (id:8222, distance:0.7703074216842651),
            (id:3993, distance:0.7664945721626282)
        ],
        '''
        num_valid_q=0
        for i,out in enumerate(results):  # milvus返回的数据结果格式解析,i 用来访问查询lab
            # id 解析, 12305  最后两位是camid  前面的是 底库图片 id
            topk = []
            gcamid = []
            for i in range(top_k): #得到排序后的图片对应的,id 和 camid,列表
                t=int,str(out[i].id)
                topk.append((map(int,t[:-2]))) #一维列表,一张图片的topk个搜寻结果 id,字符串格式)
                gcamid.append(map(int,t[-2:]))# 字符串格式
            match = (np.array(topk) == query_ids[i]).astype(np.int32)  # 一个向量和一个值比对,实现的功能是 一个查询图片label ,和底库topk张label,比对,相等1,不等0

            remove = (query_ids[i] == np.array(topk)) & (query_camids[i] == gcamid)  # 1 和[1 2 1] ==后返回[true false true]
            keep = np.invert(remove)  # true false 反过来,为了下面一行删除 keep 的 true 对应位置底库图片比对
            match= match[keep]  #删除了底库中搜索的对应相同相机id下行人检索结果,[1 0 1 ][true false false] ->[0 1],相当于删除底库的一个比对图片,排序索引应该移动变化的操作

            if not np.any(match):  # 全是0执行这里, 全是0表示 ,底库没有这张查询图片的label
                continue
            num_rel = match.sum()
            cmc = match.cumsum() #累加和[1 1 0]  返回[1  1+1  1+1+0]= [1 2 2],维度不变,对应位置匹配的数量,计算precise的分子
            tmp_cmc = [x / (i + 1.) for i, x in enumerate(cmc)]  # 循环列表元素,索引加1 top的位置也就是分母,列表元素是当前位置累加正确lab个数,分子
            tmp_cmc = np.asarray(tmp_cmc) * match  #上面是每个位置都计算了值,但是id不匹配位置的值不需要,对应match中的0
            AP = tmp_cmc.sum() / num_rel  # 一张查询图片得到的 ap
            all_AP.append(AP)  #长度是查询数据集的长度

            cmc[cmc > 1] = 1
            rank.append(cmc) #添加的是[[0 1 1] [1 1 1]]这样,当前位置id相等1, 后面全都是1 ,因为top 计算
            num_valid_q += 1.  # 这个绝对不等于num_q 注意上面有个continue,情况


    all_cmc = np.asarray(rank).astype(np.float32)  #所有测试图片匹配结果 (n,topk), n个,每个测试图片[0 1 1...]结果
    all_cmc = all_cmc.sum(0) / (num_valid_q)
    # Delete demo_collection
    status = milvus.drop_collection(collection_name)
    return all_AP,all_cmc  

def main():
    # Specify server addr when create milvus client instance
    # milvus client instance maintain a connection pool, param
    # `pool_size` specify the max connection num.
    milvus = Milvus(_HOST, _PORT)
    # Create collection demo_collection if it dosen't exist.
    collection_name = 'example_collection_'

    status, ok = milvus.has_collection(collection_name)
    if not ok:
        param = {
            'collection_name': collection_name,
            'dimension': _DIM,
            'index_file_size': _INDEX_FILE_SIZE,  # optional
            'metric_type': MetricType.IP  # optional L2 IP, 距离需要归一化输入
        }

        milvus.create_collection(param)

    # Show collections in Milvus server
    _, collections = milvus.list_collections()

    # Describe demo_collection
    _, collection = milvus.get_collection_info(collection_name)
    print(collection)

    ####################################################################################
    #添加自己的底库数据
    load_gallery_feat(milvus, collection_name)

    # Create ivflat index in demo_collection
    # You can search vectors without creating index. however, Creating index help to
    # search faster
    print("Creating index: {}".format(index_param))
    status = milvus.create_index(collection_name, IndexType.IVF_FLAT, index_param)

    # describe index, get information of index
    status, index = milvus.get_index_info(collection_name)
    # print(index)

    query_vectors =  np.random.rand(56, _DIM).astype(np.float32)
    query_vectors = preprocessing.normalize(query_vectors)
    query_ids = [id for id in range(56)]

    all_AP ,rank = map_top_test(milvus, collection_name, query_ids, query_vectors)
    if len(all_AP)<=0:
        print ("没有在底库中搜索到同样label的图片")
        return
    mAP = np.mean(all_AP)
    print("map@50:",mAP)
    print("top1:",rank[0])
    print("top10:",rank[9])


if __name__ == '__main__':
    main()
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