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前面系列文章讲过数据挖掘的各种知识,最近在研究人类时空动力学分析和幂率定律,发现在人类兴趣转移模型中,可以通过热图(斑图)来进行描述的兴趣转移,如下图所示。下一篇文章将简单普及人类动力学相关知识研究。
这篇文章结合Matplotlib的imshow()函数,讲述热图(斑图)绘制及相关参数基础知识。希望文章对你有所帮助,如果文章中存在错误或不足之处,还请海涵。
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Matplotlib是Python最著名的2D绘图库,该库仿造Matlab提供了一整套相似的绘图函数,用于绘图和绘表,强大的数据可视化工具和做图库,适合交互式绘图,图形美观。
首先,通过一段代码给大家回顾下Matplotlib绘图知识。绘制2*3共6个子图,且图为空的代码如下:
- # coding=utf-8
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- fig = plt.figure()
- ax1 = fig.add_subplot(231)
- ax2 = fig.add_subplot(232)
- ax3 = fig.add_subplot(233)
- ax4 = fig.add_subplot(234)
- ax5 = fig.add_subplot(235)
- ax6 = fig.add_subplot(236)
- plt.grid(True)
- plt.show()
运行结果如下图所示:
- # coding=utf-8
- import numpy as np
- from pylab import *
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- x = [1, 2, 3, 4]
- y = [3, 5, 10, 25]
-
- #创建Figure
- fig = plt.figure()
-
- #创建一个或多个子图(subplot绘图区才能绘图)
- ax1 = fig.add_subplot(231)
- plt.plot(x, y, marker='D') #绘图及选择子图
- plt.sca(ax1)
-
- ax2 = fig.add_subplot(232)
- plt.scatter(x, y, marker='s', color='r')
- plt.sca(ax2)
- plt.grid(True)
-
- ax3 = fig.add_subplot(233)
- plt.bar(x, y, 0.5, color='c') #柱状图 width=0.5间距
- plt.sca(ax3)
-
- ax4 = fig.add_subplot(234)
- #高斯分布
- mean = 0 #均值为0
- sigma = 1 #标准差为1 (反应数据集中还是分散的值)
- data = mean+sigma*np.random.randn(10000)
- plt.hist(data,40,normed=1,histtype='bar',facecolor='yellowgreen',alpha=0.75)
- plt.sca(ax4)
-
- m = np.arange(-5.0, 5.0, 0.02)
- n = np.sin(m)
- ax5 = fig.add_subplot(235)
- plt.plot(m, n)
- plt.sca(ax5)
-
- ax6 = fig.add_subplot(236)
- xlim(-2.5, 2.5) #设置x轴范围
- ylim(-1, 1) #设置y轴范围
- plt.plot(m, n)
- plt.sca(ax6)
- plt.grid(True)
-
- plt.show()
输出结果如下图所示:
Matplotlib强推博客:
http://www.cnblogs.com/zhizhan/p/5615947.html
http://blog.csdn.net/jinlong_xu/article/details/70183377
【Python数据挖掘课程】六.Numpy、Pandas和Matplotlib包基础知识
热图(heatmap)是数据分析的常用方法,通过色差、亮度来展示数据的差异、易于理解。Python在Matplotlib库中,调用imshow()函数实现热图绘制。
参考资料:http://matplotlib.org/users/image_tutorial.html
源码介绍如下图所示:
imshow(X, cmap=None, norm=None, aspect=None, interpolation=None, alpha=None, vmin=None, vmax=None, origin=None, extent=None, shape=None, filternorm=1, filterrad=4.0, imlim=None, resample=None, url=None, hold=None, data=None, **kwargs)
其中,X变量存储图像,可以是浮点型数组、unit8数组以及PIL图像,如果其为数组,则需满足一下形状:
(1) M*N 此时数组必须为浮点型,其中值为该坐标的灰度;
(2) M*N*3 RGB(浮点型或者unit8类型)
(3) M*N*4 RGBA(浮点型或者unit8类型)
下面这段代码是一个简单的实例:
- # coding=utf-8
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- X = [[1,2],[3,4],[5,6]]
- plt.imshow(X)
- plt.show()
输出如下图所示:
- #coding=utf-8
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- X = [[1,2],[3,4],[5,6]]
- plt.imshow(X)
- plt.colorbar()
- plt.show()
运行结果如下图所示,其中左上角颜色为蓝色,对应值为1;右下角颜色为深红色,对应值为6。它是按照矩阵X进行颜色分布的。
[1, 2] [深蓝, 浅蓝]
[3, 4] [淡绿, 黄色]
[5, 6] [橙红, 深红]
plt.colorbar(cax=None,ax=None,shrink=0.5)可设置Bar为一半长度。
- #coding=utf-8
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- X = [[1,2],[3,4]]
-
- fig = plt.figure()
- ax = fig.add_subplot(231)
- ax.imshow(X)
-
- ax = fig.add_subplot(232)
- ax.imshow(X, cmap=plt.cm.gray) #灰度
-
- ax = fig.add_subplot(233)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.spring) #春
- plt.colorbar(im)
-
- ax = fig.add_subplot(234)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.summer)
- plt.colorbar(im, cax=None, ax=None, shrink=0.5) #长度为半
-
- ax = fig.add_subplot(235)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.autumn)
- plt.colorbar(im, shrink=0.5, ticks=[-1,0,1])
-
- ax = fig.add_subplot(236)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.cm.winter)
- plt.colorbar(im, shrink=0.5)
-
- plt.show()
运行结果如下图所示:
通常图片都是由RGB组成,一块一块的,详见我的数字图像处理系列博客,这里想把某块显示成一种颜色,则需要调用interpolation='nearest'参数即可,代码如下:
- #coding=utf-8
- from matplotlib import pyplot as plt
-
- X = [[0, 0.25], [0.5, 0.75]]
-
-
- fig = plt.figure()
- ax = fig.add_subplot(121)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.get_cmap('hot'))
- plt.colorbar(im, shrink=0.5)
-
- ax = fig.add_subplot(122)
- im = ax.imshow(X, cmap=plt.get_cmap('hot'), interpolation='nearest',
- vmin=0, vmax=1)
- plt.colorbar(im, shrink=0.2)
- plt.show()
-
运行结果如下图所示:
- # coding=utf-8
- import numpy as np
- from matplotlib import pyplot as plt
- from matplotlib import cm
- from matplotlib import axes
-
- def draw_heatmap(data,xlabels,ylabels):
- #cmap=cm.Blues
- cmap=cm.get_cmap('rainbow',1000)
- figure=plt.figure(facecolor='w')
- ax=figure.add_subplot(1,1,1,position=[0.1,0.15,0.8,0.8])
- ax.set_yticks(range(len(ylabels)))
- ax.set_yticklabels(ylabels)
- ax.set_xticks(range(len(xlabels)))
- ax.set_xticklabels(xlabels)
- vmax=data[0][0]
- vmin=data[0][0]
- for i in data:
- for j in i:
- if j>vmax:
- vmax=j
- if j<vmin:
- vmin=j
- map=ax.imshow(data,interpolation='nearest',cmap=cmap,aspect='auto',vmin=vmin,vmax=vmax)
- cb=plt.colorbar(mappable=map,cax=None,ax=None,shrink=0.5)
- plt.show()
-
- a=np.random.rand(10,10)
- print a
- xlabels=['A','B','C','D','E','F','G','H','I','J']
- ylabels=['a','b','c','d','e','f','g','h','i','j']
- draw_heatmap(a,xlabels,ylabels)
运行结果如下图所示:
同时推荐大家阅读电子科技大学,赵志丹老师的博士论文《人类行为时空特性的分析建模及动力学研究》,下一篇文章我将简单讲述人类时空分析及结合Python绘图简单介绍。因为最近研究这方面知识,希望对你有所帮助,如果文章存在错误或不足之处,还请海涵。
真的好忙啊,都没时间做很多自己喜欢的事情,写文也是,但每当想起你,我这张丑脸上总会泛起微笑。加油,秀璋。娜娜,晚安!
(By:Eastmount 2017-06-19 晚上12点 http://blog.csdn.net/eastmount/ )http://blog.csdn.net/Eastmount/article/details/73392106?locationNum=3&fps=1
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