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基于 seaborn 的相关性热力图可视化分析

seaborn 相关性分析


作者:沂水寒城,CSDN博客专家,个人研究方向:机器学习、深度学习、NLP、CV

Blog: http://yishuihancheng.blog.csdn.net

seaborn本质上是对matplotlib模块的高级封装,所以要想使用seaborn的功能,首先需要安装好matplotlib的基础环境,现在的安装方式已经极大地简化了,只需要pip安装即可,这里就不再多说明了。

今天主要是想对手里的一个数据集进行简单的分析,分析不同属性特征之间的相关程度,相关性的计算有很多种方法,比如我最常用的就是基于统计学习里面的三大指数来进行计算,主要包括:皮尔森系数、肯德尔系数和斯皮尔曼系数。相关性的计算结果可以通过seaborn来进行直观的展示,接下来我们来看一下具体的代码实现,首先是数据加载部分:

  1. def Demo(data_list,savepath='relation.png'):
  2.     '''
  3.     数据加载。解析、可视化
  4.     '''
  5.     matrix=[]
  6.     A=[one[2for one in data_list]
  7.     B=[one[3for one in data_list]
  8.     C=[one[4for one in data_list]
  9.     D=[one[5for one in data_list]
  10.     E=[one[6for one in data_list]
  11.     F=[one[7for one in data_list]
  12.     G=[one[8for one in data_list]
  13.     matrix=[A,B,C,D,E,F,G]
  14.     label=['O3','Water','Temp','Humi','See','WS','WD']
  15.     relationAnalysis(matrix,label,flag='P',savepath=savepath)

接下来是具体的绘图代码实现,如下所示:

  1. def relationAnalysis(matrix,label,flag='P',savepath='relation/heatmap_pearson.png'):
  2.     '''
  3.     matrix:不同属性的数据矩阵
  4.     label:不同因子名称
  5.     '''
  6.     all_res=[]
  7.     for i in range(len(matrix)):
  8.         one_tmp=[]
  9.         vector1=matrix[i]
  10.         for j in range(len(matrix)):
  11.             vector2=matrix[j]
  12.             a=pearsonr(vector1,vector2)[0]
  13.             b=spearmanr(vector1,vector2)[0]
  14.             c=kendalltau(vector1,vector2)[0]
  15.             if flag=='P':
  16.                 one_tmp.append(a)
  17.             elif flag=='S':
  18.                 one_tmp.append(b)
  19.             elif flag=='K':
  20.                 one_tmp.append(c)
  21.             else:
  22.                 one_tmp.append((a+b+c)/3)
  23.         all_res.append(one_tmp)
  24.     heapMapPlot(all_res,label,savepath=savepath)

接下来是热力图绘制函数:

  1. def heapMapPlot(data,key_list,savepath='relation/heatmap.png'):
  2.     '''
  3.     基于相关性系数计算结果来绘制热力图
  4.     '''
  5.     colormap=plt.cm.RdBu
  6.     data=np.array(data)
  7.     fig,ax=plt.subplots(figsize=(12,12))
  8.     #不指定颜色带的色系
  9.     # sns.heatmap(pd.DataFrame(np.round(data,4),columns=key_list,index=key_list),annot=True,vmax=1,vmin=0,
  10.     #             xticklabels=True,yticklabels=True,square=True)
  11.     #指定颜色带的色系
  12.     # sns.heatmap(pd.DataFrame(np.round(data,4),columns=key_list,index=key_list),annot=True,vmax=1,vmin=0,
  13.     #             xticklabels=True,yticklabels=True,square=True,cmap="YlGnBu")
  14.     #指定颜色带的色系
  15.     # sns.heatmap(pd.DataFrame(np.round(data,4),columns=key_list,index=key_list),annot=True,vmax=1,vmin=0,
  16.     #             xticklabels=True,yticklabels=True,square=True,cmap="RdBu_r")
  17.     #指定网格间距
  18.     # sns.heatmap(pd.DataFrame(np.round(data,4),columns=key_list,index=key_list),annot=True,vmax=1,vmin=0,
  19.     #             xticklabels=True,yticklabels=True,square=True,linewidths=0.3,cmap="RdBu_r")
  20.     #指定网格间距+间距颜色
  21.     sns.heatmap(pd.DataFrame(np.round(data,4),columns=key_list,index=key_list),annot=True,vmax=1,vmin=0,
  22.                 xticklabels=True,yticklabels=True,square=True,linewidths=1,linecolor="green",cmap="RdBu_r")
  23.     #sns.heatmap(DataFrame.astype(float),linewidths=0.1,vmax=1.0, square=True, cmap=colormap, linecolor='white', annot=True)
  24.     plt.title('factorDataAnalysis')
  25.     plt.savefig(savepath)

上面的代码中,我们给出来了几种不同形式的实现,接下来我们来看一下具体的结果:

不指定颜色带色系的结果图:

指定颜色带色系的结果图:

指定网格间距的结果图:

指定网格间距+颜色的结果图:

当然了,参照官方的API接口还有很多有意思的组合和参数可以去设置和使用,这里给出来了几种比较常用的方式,感兴趣的话可以拿去试试。

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