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AI医学影像技术展望
医学影像是指为了医疗或医学研究,对人体或人体某部分,以非侵入方式取得内部组织影像的技术与处理过程。它包含以下两个相对独立的研究方向:医学成像系统(medical imaging system)和医学图像处理(medical image processing)。前者是指图像行成的过程,包括对成像机理、成像设备、成像系统分析等问题的研究;后者是指对已经获得的图像作进一步的处理,其目的是或者是使原来不够清晰的图像复原,或者是为了突出图像中的某些特征信息,或者是对图像做模式分类等等。
医学影像发展至今,除了X 射线以外,还有其他的成像技术,并发展出多种的影像技术应用。另外在生医资讯应用方面,为能所产生的数位影像档案与影像数位化档案,可以交换与查阅,发展出医疗数位影像传输协定技术。常用的医学影像技术包括:
血管摄影 (Angiography):或称动脉摄影、血管造影,是用x光照射人体内部,观察血管分布的情形,包括动脉、静脉或心房室。
心血管造影 (Cardiac angiography):将造影剂通过心导管快速注入心腔或血管,使心脏和血管腔在X线照射下显影,同时有快速摄片,电视摄影或磁带录像等方法,将心脏和血管腔的显影过程拍摄下来,从显影的结果可以看到含有造影剂的血液流动顺序,以及心脏血管充盈情况,从而了解心脏和血管的生理和解剖的变化。是一种很有价值的诊断心脏血管病方法。
参考文献链接
https://baike.baidu.com/item/%E5%8C%BB%E5%AD%A6%E5%BD%B1%E5%83%8F/4954291?fr=aladdin
https://mp.weixin.qq.com/s/d1AbNfYlR6WdelQ209hBcw
https://mp.weixin.qq.com/s/MrE-ogQtHu4vRJBH9M_Qyg
电脑断层扫描 (CT, Computerized tomography),或称电子计算机断层扫描,根据所采用的射线不同可分为:X射线CT(X-CT)、超声CT(UCT)以及γ射线CT(γ-CT)等。
乳房摄影术(Mammography):是利用低剂量(约为 0.7毫西弗)的X光检查人类(主要是女性)的乳房,它能侦测各种乳房肿瘤、囊肿等病灶,有助于早期发现乳癌。
正子发射断层扫描 (PET, Positron emission tomography):是一种核医学成像技术,它为全身提供三维的和功能运作的图像。是目前唯一的用解剖形态方式进行功能、代谢和受体显像的技术,具有无创伤性的特点,是目前临床上用以诊断和指导治疗肿瘤最佳手段之一。
核磁共振成像 (NMRI, Nuclear magnetic resonance imaging):通过外加梯度磁场检测所发射出的电磁波,据此可以绘制人体内部结构。
医学超音波检查 (Medical ultrasonography):运用超声波的物理特性,通过电子工程技术对超声波发射、接收、转换及电子计算机的快速分析、处理和显象,从而对人体软组织的物理特性、形态结构与功能状态作出判断的一种非创伤性检查方式,使肌肉和内脏器官——包括其大小、结构和病理学病灶——可视化。
医学影像AI算法和研究
近日,第四届图像计算与数字医学国际研讨会(ISICDM 2020),在辽宁省沈阳市的东北大学国际学术交流中心举办。
在开幕式环节中,中科院自动化研究所田捷教授以《医学影像中的人工智能的算法和研究热点》为题做了大会报告。
田捷教授现任中国科学院自动化所研究员、分子影像重点实验室主任、北航-首医大数据精准医疗高精尖创新中心主任。
自2010年起,田捷教授连续获得计算机视觉与医学影像分析领域的9大Fellow,其中包括AAAS 、IEEE 、IAMBE 、SPIE 、AIMBE 、IAPR 、OSA 、ISMRM 、WMIS。同时也是两项国家重点基础研究发展计划(973计划)首席科学家。
他主要从事医学影像分析与生物特征识别的研究和应用的工作,还长期从事光学分子影像研究,在光学分子成像等领域做出了系统性、创新性贡献,特别是生物自发光和激发荧光断层成像及其应用方面。
征得田捷教授同意后,提供PPT供大家学习和下载。关注公众号《医健AI掘金志》,对话框回复“田捷”即可获取。
以下是田捷演讲全文,雷锋网《医健AI掘金志》做了不改变原意的编辑:
田捷:今天和大家汇报的题目是《医学影像中的人工智能的算法和研究热点》,分为以下几个方面:包括自己团队对医学影像人工智能的工作进展,以及回归临床的人工智能到底给患者和临床带来什么收益。
人工智能跟医学影像密切相关,这是斯坦福大学放射系主任,Sanjiv Sam Gambhir的归纳,从人工智能的早期像符号系统期,就开始用医学影像来做良恶性判断,再到AI 2.0机器学习,判断会更加准确,再到AI的3.0。
随着方法不断更新,人工智能在医学影像中的应用也越来越深入,越来越多临床问题被更好的解决,使得患者能最终获益。
另一方面,医生和机器学习的关系,引用斯坦福大学Sanjiv Sam Gambhir教授在WMIC 2018给出的例子,从医生角度来看,人工智能是计算机做人类认为智能的事,其从大到小包括机器学习、神经网络、深度学习。同时深度学习更适合解决像超声这样人工难以定义特征的影像,下面的表述也是验证他这样的观点。
AI的另一重要概念即大数据,一个病人影像的每个断层是512×512的像素,200个断层即可组成5000多万个体素,形成100010万个影像特征,医生看片不可能看到100010万个特征。
但计算机可以通过高通量处理对信息进行降维,使得诊断更准确,从而辅助医生进行决策。
下面我将主要分享,以人工智能为核心,在数据、图像、知识这三个环之间的作用。
CT、磁共振把信号变成图像,让人眼来判读,来提取特征,人脑来加工,最终形成诊断知识,这恰好是现在影像组学和人工智能,医学影像的研究热点。我将对这些热点,进行逐个分析。
首先从信号到图像,过去都是医学影像器械厂商完成,例如从K-空间,磁共振图像生成,有一系列物理模型和数学模型,像莱登投影,螺旋采样等这一系列方法。
但现在人工智能也在干这事,使得从复杂频率信号到实域变换,生成人眼能看的磁共振图像,经过训练以后,从图像中获取知识给出判断,但这种重建方法受到了降采样噪声干扰,使得很多图像失真。
而人工智能不需要物理模型和数学公式,可以直接从信号到图像,既克服失真,又可高质量重建。此外AI重建出来的结果,颠覆了过去由物理模型和数学算法降采样得到图像的方式,其信噪比更高,图像质量更好。
到了更好图像质量效果,对厂商也起到了颠覆和促进作用,该工作是由哈佛大学医学院完成的,第一作者是中国人。
团队也开展了类似工作,通过训练样本得到光源位置,不需要经过辐射传播方程来近似求解,以深度学习进行重建,其中没有复杂物理过程和简化数学模型,这个工作也发表在了Optica上。该工作以深度学习进行重建,与前面磁共振逻辑思路类似,按照这个思路做了一个系列,包括自发荧光,激发荧光,光声成像。
从信号到图像完全可以用深度学习,噪声更低,效果更好,颠覆了复杂物理过程和数学模型,使得重建更加有效。
回归到今天的主要内容:图像到知识。
重点从4个方面进行汇报:基于人工智能的影像组学方法;基于深度学习的影像智能诊断;特异性新型卷积神经网络模型;医疗人工智能的前沿热点方向。
基于人工特征
的影像组学分析
影像组学概念综合了医学影像、基因和临床大数据,用人工智能高通量提取疾病相关信息,辅助临床决策,和医生看片是一样的逻辑。
医生看病是从影像提取特征,人眼看结构特征,根据经验进行人脑加工,最后给出决策。计算机通过影像数据,定量提取高通量特征,人工智能建模来辅助决策。
其中最大区别是人眼看的是结构,计算机看到的是高维信息。
高维信息能够提取微观基因蛋白信息在宏观影像上的表达,从而反映人体组织细胞和基因水平变化,使得诊断更准确,治疗更有效,这是影像组学意义所在。
影像组学也可以跟其他组学融合,通过人工智能高通量的提取特征信息,再进行建模,实现精准诊断、预后预测以及治疗方案选择。
围绕着这几个方面举典型案例,说明人工智能到底解决了什么问题,患者的获益在哪里。
人工智能对医学来说到底效果是什么?
对临床来说,影像是无创的,病理是有创的,通过手术和穿刺才能得到。病理是微观,影像是宏观,如果借助人工智能从宏观影像上挖掘出微观信息,把影像逼近病理,使两个技术1+1>2,诊断将更准确。
另一方面,把宏观影像跟外部预后结合在一起,定量分析影像数据和临床数据,也能够辅助疾病个性化诊疗和精准预测。
其中最重要的就是特征,人眼只能看到形状特征。一些高维特征、标准方差、能量、复杂灰度、共生矩阵特征和熵,人眼都没办法看,也没办法加工,但计算机可以处理这些高维信息。
这是广东省人民医院刘再毅教授发表在Radiology的一篇文章。中间结构图是影像;两个癌症患者年龄差不多,结构特征能看到的信息差不多相同。
放射科大夫写报告都会描述形状不规则,边缘较模糊,长径多少,只能让临床外科和内科大夫去做判断。
但这两个人的预后差别很大,一个5年半没有复发,一个一年半就去世了。
这就是肿瘤异质性,从结构上看不到这两个患者的预后和肿瘤异质性(肿瘤本质的差别)。
觉得医工交叉要解决问题,研究思路应该是源于临床提出问题,要具体化,越具体越好。特别是现在临床解决不了的某一个点上的某一个具体问题,找适合的人工智能的数据处理方法和分析方法,最后回归临床应用。
下面我会举一些例子,说明了人工智能的效果。不同应用目的的工作为例子,以印证上面研究思路,案例均摘自Ebiomedicine(柳叶刀子刊)。
案例一:新辅助治疗效果评估
这是与南方医院合作的科研案例,针对特定临床问题:局部晚期宫颈癌治疗前难以预测新辅助治疗疗效。采用了275例新辅助化疗前宫颈癌多中心多序列MR影像。
用人工智能多序列、多区域MR影像组学特征分析,实现局部晚期宫颈癌患者的新辅助疗效精准预测。从过去不能从磁共振图看出问题,到借助人工智能加磁共振的分析达到精准预测。
这个成果发表在医学杂志Ebiomedicine上,国际同行法国教授Dimitris Visvikis认为该研究表明在多中心验证影像组学模型是可行的,该工作将促进影像组学的临床应用转化。
案例二:孕妇产后出血预测
这是与河南省人民医院合作的案例:通过分析近300例胎盘增生孕妇产前MR影像、MR影像组学特征,对多中心T2WI序列进行智能分析实现孕妇剖腹产发生出血的精准预测。
案例三:肝硬化门脉高压预测
前面是影像逼近病理,这是对肝静脉压梯度测量的预测,通过回顾性CT图像数据进行学习预测,提取了特征再进行前瞻性AI预测,效果也不错。
案例四:远处转移风险评估
鼻咽癌远处转移风险评估案例中,使用176例鼻咽癌患者MR影像进行数据定量分析,实现治疗前对鼻咽癌患者远处转移风险的精准预测。
案例五:脑膜瘤脑组织侵袭风险评估
第五个案例是脑膜瘤脑组织侵袭风险的预测。脑膜瘤患者会有术前评估不准确性,取1728例术前脑膜瘤患者多序列MR影像,分析定量影像组学特征与脑组织侵袭潜在关联,实现了脑膜瘤患者脑组织侵袭风险精准预测。
这些案例都是以问题为导向,说明人工智能解决临床的特定问题,但问题一定是源于临床,找到一个特定问题,高于临床找到适合的方法,回归临床看效果。
对于AI找肺结节类问题在临床上并不一定有实际意义,也许方法很炫,在特定数据集上也很有效,但距离实际的临床问题和患者都太远。
基于深度学习的影像智能诊断
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