【脑神经软件学习】头部矫正遇到的问题及解决_dwifslpreproc: [error] eddy* --imain=eddy_in.nii -

最近被一个问题困扰，在执行Mrtrix3上的头部矫正代码的时候：

for_each * : dwifslpreproc IN/dwi_denoised_unringed.mif IN/dwi_denoised_unringed_preproc.mif -rpe_none -pe_dir AP

明明安装了fsl，但是运行结果却是报错（说没有找到 FSL eddy 的指令）：

 确实不知道该怎么处理，后来师兄和我说，可以直接使用fsl的eddy_correct函数，在终端里进行矫正，eddy_correct使用方法是：

Usage: eddy_correct <4dinput> <4doutput> <reference_no> [<interp>]
       Choose interp from {trilinear,spline} def - trilinear 

然后我就又去操作去了，依然报错：

  File "/usr/share/fsl/5.0/bin/imglob", line 78
    print "Usage: $0 [-extension/extensions] <list of names>"
                                                            ^
SyntaxError: Missing parentheses in call to 'print'. Did you mean print("Usage: $0 [-extension/extensions] <list of names>")?
 
Usage: fslmerge <-x/y/z/t/a/tr> <output> <file1 file2 .......> [tr value in seconds]
     -t : concatenate images in time
     -x : concatenate images in the x direction
     -y : concatenate images in the y direction
     -z : concatenate images in the z direction
     -a : auto-choose: single slices -> volume, volumes -> 4D (time series)
     -tr : concatenate images in time and set the output image tr to the final option value

 他报错的地方是官网文件，我就没仔细看报错原因，一直以为是我操作不当或者是fsl没有装好而导致的！我装了好几个fsl的版本，下载速度特别慢，导致我最近很无聊也很沮丧。

今天早上！正当装fsl无聊的时候，去做今天的五题，有一个Python2和Python3的区别！我当时看了一眼！没想到下午就遇到了！

Pyhton2.6和2.7以及Python3在Print语句上是有不同的，区别如下：

Python 2.6与Python 2.7部分地支持这种形式的print语法。在Python 2.6与Python 2.7里面，以下三种形式是等价的：

print "hello world"    #没有括号
print ("hello world")  #注意print后面有个空格
print("hello world")   #print()不能带有任何其它参数

但也只是部分地支持，特别是Python3后是没有print语句了，只有Print()函数

官网的这个文件可能是很早之前的了，用的版本是老版本的Print语句，和我现在用的Python不兼容，导致了报错

改正办法就是：去/usr/share/fsl/5.0/bin/imglob这个Python文件里，把所有Print语句改为Print()函数

然后运行，就可以了

一个小问题，又卡了好几天，导致了我最近的无聊，emm~

终于可以往下走了，真好