github上传_上传R package到GitHub

GitHub教程：git/github guide和Putting your R package on GitHub

1. 申请一个github账户：Build software better, together，注意要在email中确认

2. 下载和安装git（Mac用户不需要）

3. 设置git的账户名（如username）和关联你已有的邮箱（username@mail.com）

4. 打开终端，输入

$ git config --global user.name "username"
$ git config --global user.email "username@mail.com"

不要输入“$”号，这只是表示后面是一串Linux命令

5. 设置ssh，参考Connecting to GitHub with SSH

6. 查看是否有id_rsa和id_rsa.pub文件，即按command+空格，输入~/.ssh/id_rsa或者~/.ssh/id_rsa.pub，若没有，在终端中输入

$ ssh-keygen -t rsa -C "username@mail.com"

7. 复制公共秘钥（即id_rsa.pub文件中的内容），或在终端输入

$ pbcopy < ~/.ssh/id_rsa.pub

8. 转到你的github账户Build software better, together，点击左侧的"SSH Keys"，再点击右侧的"Add SSH Key"，在上方空格处添加一个标签如"My Laptop"，在下方大空格处粘贴你刚刚复制的公共秘钥，然后在终端输入

$ ssh -T git@github.com

如果出现类似如下信息，则github设置成功

Hi username! You've successfully authenticated, but Github does
not provide shell access.

9. 在终端中cd你的package的文件路径（如包名为sayHello）

$ cd /Users/liuyiming/Desktop/sayHello

8. 打开你的github首页，create a new repository

输入repository name（如sayHello）并点击生成README

9. 生成sayHello项目后，点击clone and download，再点击复制按钮

10. 在终端输入

$ git clone git@github.com:liuyiming1121/sayHello.git  
# git clone后的部分是直接粘贴的

此时你的sayHello文件夹中多一个同名的sayHello文件，把第一个sayHello文件中的子文件(R, man, src等等)拷贝到这个同名的sayHello文件中，并且cd到此子文件

$ cd /Users/liuyiming/Desktop/sayHello/sayHello 

11. 在终端中依次输入

$ git init
$ git add .
$ git commit -m "updated"
$ git push

刷新一下你的sayHello项目，出现要上传的文件，则操作成功。

12. 可以建立一个inst文件，保存所有的说明文档

13. 修改文件

比如要在sayHello项目中新添加一个文件夹名为src，则在终端中输入

$ cd /Users/liuyiming/Desktop/sayHello/sayHello 
$ git add 文件夹名
$ git commit -m "修改内容描述"
$ git push

可将整个文件夹添加进去

14. 如果Rpackage要用到Rcpp，则在src文件中需要额外添加两个文件Makervars和Makervars.win，内容如下

# Makervars
PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"`
PKG_LIBS =$(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)
# Makervars.win
PKG_CPPFLAGS = -I../inst/include
PKG_LIBS = $(shell "${R_HOME}/bin${R_ARCH_BIN}/Rscript.exe" -e "Rcpp:::LdFlags()")
PKG_LIBS =$(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)