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torch_geometric踩坑实战--安装与运行 亲测有效!!_torch-geometric

torch-geometric

torch_geometric是PyG中必不可少的一个包,也是进行图神经网络学习的必备,然而安装这个包并运行一段简单的代码踩了不少坑,记录一下。

1、安装torch_geometric

一开始,我直接pip

pip intsall torch_geometric

果然报错,提示没有torch_sparse

很显然是没有安装依赖,于是我去查需要哪些依赖

官网地址:Installation — pytorch_geometric documentation (pytorch-geometric.readthedocs.io)

按照官网给出的代码进行安装

pip install pyg_lib torch_scatter torch_sparse torch_cluster torch_spline_conv -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.13.0+cpu.html

运行依旧没有成功...

于是手动下载

下载地址:https://data.pyg.org/whl/

另一个下载地址:pytorch-geometric.com/whl/torch-1.4.0.html

(1)卸载安装的相关包

pip uninstall torch-geometric torch-scatter torch-sparse torch-cluster torch-spline-conv

(2)选择适合自己的torch和cuda版本

 (3)按照自己的python版本和操作系统下载

(4)进入conda激活虚拟环境,然后进入下载地址

这里注意需要进入D盘,cmd中进入D盘的命令为:

D:

 然后cd进入包的下载页面,直接pip install

安装完所有的依赖后记得 

pip install torch_geometric

 2、运行代码

import torch_geometric

 依旧报错:

Pytorch AttributeError: module 'torch' has no attribute 'sparse_scs'

这个就很让人费解,于是查看了一下

 发现torch.sparse里面确实没有这个模块,那为什么会报错呢?查看一些帖子后发现报这种错一般是因为版本不对,于是,降低torch_geometric版本,果然成功!!

我的版本:

 至此就安装成功啦!!

简单跑了个程序

  1. import torch.nn.functional as F
  2. class GCN(torch.nn.Module):
  3. def __init__(self, num_node_features, num_classes):
  4. super(GCN, self).__init__()
  5. self.conv1 = GCNConv(num_node_features, 16)
  6. self.conv2 = GCNConv(16, num_classes)
  7. def forward(self, data):
  8. x, edge_index = data.x, data.edge_index
  9. x = self.conv1(x, edge_index)
  10. x = F.relu(x)
  11. x = F.dropout(x, training=self.training)
  12. x = self.conv2(x, edge_index)
  13. x = F.relu(x)
  14. x = F.dropout(x, training=self.training)
  15. x = F.softmax(x, dim=1)
  16. return x
  17. model = GCN(dataset.num_node_features, dataset.num_classes)
  18. print(model)
  19. def train(model, data):
  20. optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=1e-4)
  21. loss_function = torch.nn.CrossEntropyLoss()
  22. model.train()
  23. for epoch in range(200):
  24. out = model(data)
  25. optimizer.zero_grad()
  26. loss = loss_function(out[data.train_mask], data.y[data.train_mask])
  27. loss.backward()
  28. optimizer.step()
  29. print('Epoch {:03d} loss {:.4f}'.format(epoch, loss.item()))
  30. train(model,data)

运行结果:

没问题!!接下来就可以建立一个自己的图神经网络啦~ 

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