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linux安装github上的R包_linux中使用devtools安装github包

linux中使用devtools安装github包

这几天在服务器上装github上的R包折磨了2天,写个帖子记录一下

描述:

(在linux服务器上,没有root权限)

直接 devtools::install_github("...") 报很多包是非零状态 had non-zero exit status

方法:

解决办法是把所有报非零状态的R包都各自安装好,再使用devtools::install_github("...") 就装好了

  • 安装前先library()一下看是否存在

1、首选 使用conda安装:conda install r-package_name

  • 记得检查一下:该包页面的更新日期是否在最近,名称为r-xx
conda install r-package_name  # 把package_name改成自己需要装的包名

2、当conda安装报错:找不到地址时,打开R使用BiocManager包安装

报错显示:

PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels:

解决方法:

  1. library(BiocManager)
  2. BiocManager::install("package_name") # package_name需自行替换为想要安装的包的名称

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