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plot3D | 三维数据绘图(1):散点图、栅格图、透视图

plot3d

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plot3D可以视作基础包graphcis的拓展包,用于多维数据的图形绘制。基础绘图系统里好像只有一个persp()函数与三维绘图有关,关于该函数的介绍见如下推文:

基础绘图系统(九)——栅格图、点密度图、等高线(填充)图、三维图

plot3D包的作者写道:“很多函数都源自persp()函数,另外一些函数来自imagecontour()”。

本篇目录如下:

  • 1 三维散点图

    • 1.1 scatter3D函数

    • 1.2 points3D和lines3D函数

    • 1.3 scatter2D函数

  • 2 栅格图

    • 2.1 image2D函数

    • 2.2 image3D函数

  • 3 透视图

    • 3.1 persp3D函数

    • 3.2 ribbon3D函数

library(plot3D)

1 三维散点图

1.1 scatter3D函数

scatter3D()函数可以帮助我们绘制三维散点图。以下是scatter3D()函数的一个简单例子:

  1. set.seed(1126)
  2. x <- runif(60)[1:20]
  3. y <- runif(60)[21:40]
  4. z <- runif(60)[41:60]
  5. scatter3D(x, y, z)
072cef48963e31a4b8480a55d0eca7a3.png

该函数还有许多参数,完整语法结构如下:

  1. scatter3D (x, y, z, ..., colvar = z, phi = 40, theta = 40,
  2.            col = NULL, NAcol = "white", breaks = NULL,
  3.            colkey = NULL, panel.first = NULL, 
  4.            clim = NULL, clab = NULL, 
  5.            bty = "b", CI = NULL, surf = NULL, 
  6.            add = FALSE, plot = TRUE)
  • x、y、z:坐标参数;向量结构,长度必须相同;

  • colvar:映射颜色的变量;默认与z参数相同,如自定义须与坐标参数长度相同;

  • col:colvar所映射的颜色带;默认见上示例,自定义见jet.col()等函数帮助文档;

  • NAcol:colvar中缺失值所映射的颜色;

  • phi、theta:俯视角度、x-y平面旋转角度,同persp()函数;默认值均为40;

  • clim:colvar中用于映射颜色的变量范围,范围以外按缺失值处理。

  1. scatter3D(x, y, z, colvar = z, col = gg.col(100),
  2.           clim = c(00.5), NAcol = "red")
cc1104198b645447f113d79c0449667d.png
  • breaks:颜色离散化的分位点;

  • colkey:图例的参数列表,详见colkey()函数;

  • clab:图例标题。

  1. scatter3D(x, y, z, breaks = seq(01, length.out = 5),
  2.           colkey = list(side = 2, width = 0.5, lwd.ticks = 0.1,
  3.                         family = "mono"),
  4.           clab = "颜色")
b7acd309801cee9454396109a7ea0be4.png
  • ...:继承persp()perspbox()函数的参数,详见函数帮助文档。

除此之外,因为plot3D是基础绘图系统的拓展包,par()函数的参数也能使用。

  1. par(family = "mono")
  2. scatter3D(x, y, z, ticktype = "detailed")
d073b4f460a6bfa0900fb00c81c14da0.png

1.2 points3D和lines3D函数

散点可以连成线。像基础绘图系统的plot()函数一样,scatter3D()函数也可以使用type参数设置不同的连线方式。

  1. par(mfrow = c(2,2))
  2. par(plt = c(0.05,0.85,0.05,0.95))
  3. scatter3D(x, y, z, type = "p")
  4. par(plt = c(0.1,0.9,0.05,0.95))
  5. scatter3D(x, y, z, type = "l")
  6. par(plt = c(0.05,0.85,0.05,0.95))
  7. scatter3D(x, y, z, type = "o")
  8. par(plt = c(0.1,0.9,0.05,0.95))
  9. scatter3D(x, y, z, type = "h")
ecf8d92f14778a6e565dfdc231908a49.png

points3D()lines3D()函数分别是type = ptype = "l"时的快捷函数。

  1. par(mfrow = c(1,2))
  2. par(plt = c(0.05,0.85,0.05,0.95))
  3. points3D(x, y, z)
  4. par(plt = c(0.1,0.9,0.05,0.95))
  5. lines3D(x, y, z)
585a37ea2515e62fad254a74ffe3ad79.png

1.3 scatter2D函数

scatter2D()函数是scatter3D()函数的二维形式,没有z参数,但是colvar参数仍然能反映第三维属性值。

scatter2D(x, y, colvar = z, pch = 19)
e0f4ef0bae43a30cbb72f707cf440273.png

points2D()lines2D()函数同理。

2 栅格图

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