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nglview ipython/jupyter插件查看分子结构可视化效果;nglview加载蛋白和小分子示例

nglview

参考:https://github.com/nglviewer/nglview

1、nglview ipython/jupyter插件安装

非常建议用conda直接安装,简单少错误
conda create -n your_env python=3.8
source activate your_env
conda install -c conda-forge nglview
jupyter-nbextension enable nglview --py --sys-prefix
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import nglview as nv

view = nv.demo()
view
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在这里插入图片描述

下面的安装错误解决方法,可能解决好还是有问题:

## 安装
pip install nglview
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在这里插入图片描述

运行报错(参考:https://github.com/yWorks/yfiles-jupyter-graphs/issues/18):

AttributeError: ‘super’ object has no attribute ‘ipython_display

##解决方法:
ipywidgets 进行降级,需要<8

pip i
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