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深度学习——超大病理图像mask的保存与读取

深度学习——超大病理图像mask的保存与读取

保存

对于100000x80000级别的黑白mask,在保存的时候有三种方式
1、用cv2.imwrite()保存成.tiff格式 (推荐)
2、用tifffile.imwrite()保存成.tiff格式(占用空间很大)
3. 用np.save保存成.npy格式 (占用空间很大)

读取

1、使用openslide.ImageSlide() (顺序颠倒)
2、使用cv2.imread ()(顺序颠倒)
3、使用tifffile.imread() (推荐)

opencv 和PIL超限问题

from PIL import ImageFile,Image
ImageFile.LOAD_TRUNCATED_IMAGES = True
Image.MAX_IMAGE_PIXELS = None
os.environ["OPENCV_IO_MAX_IMAGE_PIXELS"] = pow(2,50).__str__()
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