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阅读笔记（FedGraphNN: A Federated Learning Benchmark System for Graph Neural Networks）

作者：笔触狂放9 | 2024-03-15 06:50:29

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fedgraphnn

源码：https://github.com/FedML-AI/FedGraphNN

大多数图学习模型如图神经网络(Graph Neural Networks，GNNs)都是基于大量的图数据进行训练的，然而在许多现实场景中，例如医疗保健系统中的住院预测，图数据通常存储在多个数据所有者处，由于涉及患者的隐私和相关法律法规限制，不同数据所有者的数据不能直接共享。

联邦学习（Federated Learning, FL）是一种分布式学习方案，通过多个参与方（即客户端）协作训练一个模型而无需共享他们的隐私数据，以解决数据隔离问题。图联邦学习(Federated Graph Learning，FGL)是联邦学习在图数据上的应用，通过以联邦方式训练图神经网络，来解决图数据隐私保护的问题。

文章将图联邦学习根据处理对象的不同分为了以下三类：

（a）图级联邦学习：每个参与图联邦学习的客户端都持有一组图数据，例如在生物化学行业中，一个分子可以表示为一个图，其中节点表示原子，边表示化学键，客户端持有的图数据包括多个分子图，典型的应用是图分类。现实场景包括分子试验、蛋白质发现等。

（b）子图级联邦学习：每个客户端拥有整张图的一部分数据（即子图），典型应用为链接预测、节点分类。现实场景包括推荐系统、知识图谱补全等。

（c）节点级联邦学习：每个客户端持有包含一个或多个节点的自我中心网络，对于每个节点来说，只能看到其k-top邻居节点及边。其中典型的任务是节点分类和链路预测。现实场景包括社交网络、传感器网络等。

FedGraphNN：

文章给出了 FGL模型的范式表示。假设在FedGraphNN统一框架中包括一个服务器（FL Server）和 $K$ 个客户端（FL Client）。每一个客户端拥有一份私密的数据集，并使用 GNN 模型进行本地的训练及预测。每一个客户端借助服务器彼此协作以改进其GNN模型，而无需直接共享数据集。其中，第 $k$ 个客户端拥有数据集 $D^{(k)}:=(G^{(k)},Y^{(k)})$ ，而 $G^{(k)}=(\nu ^{(k)},\varepsilon ^{(k)})$ 表示由节点和边构成的图，并具有节点特征集 $X^{(k)}=\left \{ x_{m}^{k} \right \}_{m\in \nu^{(k)}}$ 、边特征集 $Z^{(k)}=\left \{ e_{m,n}^{k} \right \}_{m,n \in \nu ^{(k)}}$ 。 $Y^{(k)}$ 表示图的标签。

FedGraphNN框架下，每一个客户端内的 GNN 模型以消息传递网络（Message Passing Neural Network，MPNN）的形式给出，大多数的基于空域的 GNN 模型都可以用 MPNN 的形式表示。MPNN 模型包括两个阶段：消息传递阶段（message-passing phase）和读出阶段（readout phase），如下图所示。

Phase 1 消息传递阶段：

消息传递阶段包括两个步骤：（1）模型收集和转换邻居的消息；（2）模型使用聚合的消息来更新节点的隐藏状态。

对于客户端 $k$ 的第 $l$ 层（ $l=0,1,...,L-1$ ），一个 $L$ 层的 MPNN 表示为：

$m_{i}^{(k,l+1)}=AGG(\left \{ M_{\theta }^{(k,l+1)}(h_{i}^{(k,l)},h_{j}^{(k,l)},z_{i,j})|j\in N_{i} \right \})$

$h_{i}^{(k,l+1)}=U_{\varnothing }^{(k,l+1)}(h_{i}^{(k,l)},m_{i}^{(k,l+1)})$

其中， $h_{i}^{(k,0)}$ 为客户端 $k$ 第 $l$ 层的节点特征，当 $l=0$ 时有 $h_{i}^{(k,0)}=x_{i}^{(k)}$ 。 $AGG(\cdot )$ 代表一种聚合函数，在GCN模型中，该聚合函数即简单的SUM操作。 $N_{i}$ 表示节点 $i$ 的邻居节点集， $M_{\theta }^{(k,l+1)}$ 是一种消息生成函数，以当前节点 $h_{i}$ 、相邻节点 $h_{j}$ 隐藏状态以及边特征 $z_{i,j}$ 为输入。 $U_{\varnothing }^{(k,l+1)}$ 为隐层状态更新函数。

Phase 2 读出阶段：

上一阶段完成了消息传递后，学习到各个节点的隐藏状态，即MPNN的最后一层输出。接下来可根据下游任务的不同，执行不同的读出处理（类似于解码的操作），它可以写作：

$\hat{y}_{S}^{(k)}=R_{\delta }(\left \{ h_{i}^{(k,L)}|i\in \nu _{S}^{(k)} \right \})$

其中， $S$ 可以是单个节点（节点分类任务）、节点对（链接预测任务）或者节点集（图分类任务）。 $R_{\delta }$ 可以是级联函数或者是池化函数（例如多层感知机MLP）。

FGL：

可从全局角度定义 $W=\left \{ M_{\theta } ,U_{\varnothing },R_{\delta }\right \}$ 为客户端 $k$ 的图神经网络模型的所有可训练权重参数，令其第 $T$ 轮的本地参数为 $W^{k,T}$ 。所有客户端将自身的本地参数上传到服务器，服务器使用聚合机制得到全局参数 $W^{(k,T+1)}$ ，然后下放回各个本地客户端。因此 FedGraphNN可以看作是一个分布式优化问题，其优化目标为调节 $W$ 以使 $F(W)$ 最小化：

其中， $f^{(k)}(W)=\frac{1}{N^{(k)}}\sum_{i=1}^{N^{(k)}}L(W;x_{i}^{(k)},z_{i}^{(k)},y_{i}^{(k)})$ 代表客户端 $k$ 本地目标函数衡量具有 $N^{(k)}$ 个数据样本的图数据集 $D^{(k)}$ 的局部经验风险。 $L$ 代表全局GNN模型的损失函数。

为解决此优化问题，最直接的方案是FedAvg。在FedAvg中，服务器上的聚合函数只是平均了模型参数。另外，FedAvg是随机选取若干个客户端进行本地更新，但是是对所有客户端的模型进行聚合，而未被选中的客户端的模型参数有 $w_{t+1}^{(k)}=w_{t}^{(k)}$ 。

FedGraphNN 归纳地使用GNN（即模型独立于被训练的图的结构），因此，服务器在参数聚合过程中不需要任何客户端的图拓扑信息。也可以应用其他先进的算法，如 FedOPT、FedGKT 和 Decentralized FL。

支持的GNN模型：GCN、GAT、GraphSage、SGC、GIN。

支持的FL算法：FedAvg、FedOPT。

FedGraphNN架构图：

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