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基于nn.Module,可以通过Sequential,ModuleList和ModuleDict三种方式定义PyTorch模型。
对应模块为nn.Sequential()。当模型的前向计算为简单串联各个层的计算时,Sequential类可以通过更加简单的方式定义模型。它可以接受一个子模块的有序字典(OrderedDict)或者一系列子模块作为参数来逐一添加Module实例,而模型的前向计算是将这些实例按添加的顺序逐一计算。
- class MySequential(nn.Module):
- from collections import OrderedDict
- def __init__(self, *args):
- super(MySequential, self).__init__()
- if len(args)==1 and isinstance(args[0], OrderedDict):
- #如果传入的是一个OrderedDict
- for key, module in args[0].items():
- self.add_module(key, module)
- # add_module方法会将module添加进self._modules(一个OrderedDict)
- else:
- for idx, module in enumerate(args):
- self.add_module(str(idx), module)
-
- def forward(self, input):
- # self._modules返回一个OrderedDict,保证会按照成员添加顺序遍历成
- for module in self._modules.values():
- input = module(input)
- return input
使用Sequential来定义模型只需要将模型的层按序排列起来,根据层名的不同,排列时有两种方式:
- #直接排列
- import torch.nn as nn
- net = nn.Sequential(
- nn.Linear(784, 256),
- nn.ReLU(),
- nn.Linear(256, 10),
- )
- print(net)
-
- #使用OrderedDict
- import collections
- import torch.nn as nn
- net2 = nn.Sequential(collections.OrderedDict([
- ('fc1', nn.Linear(784, 256)),
- ('relu1', nn.ReLU()),
- ('fc2', nn.Linear(256, 10))
- ]))
- print(net2)
使用Sequential定义模型的好处在于简单、易读,不需要再写forward,因为顺序已经定义好了。但使用Sequential会使得模型定义丧失灵活性,比如需要在模型中间加入一个外部输入时就不适合用Sequential的方式实现。
对应模块为nn.ModuleList()。ModuleList接收一个子模块的列表作为输入,也可以append和extend操作。同时,子模块或层的权重也会自动添加到网络中来。
- net = nn.ModuleList([nn.Linear(784, 256), nn.ReLU()])
- net.append(nn.Linear(256, 10))
- print(net[-1])
- print(net)
nn.ModuleList并没有定义网络,只是将不同的模块储存在一起。
ModuleList中元素的先后顺序不代表其在网络中的真实位置顺序,需要经过forward函数指定各个层的先后顺序后才算完成了模型的定义。具体实现时用for循环即可完成
- class model(nn.Module):
- def __init__(self, ...):
- super().__init__()
- self.modulelist = ...
- ...
-
- def forward(self, x):
- for layer in self.modulelist:
- x = layer(x)
- return x
对应模块为nn.ModuleDict(),能够更方便地为神经网络的层添加名称。
- net = nn.ModuleDict({
- 'linear':nn.Linear(784, 256),
- 'act':nn.ReLU(),
- })
- net['output'] = nn.Linear(256, 10)
- print(net['linear'])
- print(net.output)
- print(net)
Sequential适用于快速验证结果,不需要同时写__init__和forward;
ModuleList和ModuleDict在某个完全相同的层需要重复出现多次时,可以“一行顶多行”;
当需要之前层的信息时,比如ResNets中的残差计算,当前层的结果需要和之前层中的结果进行融合,一般使用ModuleList/ModuleDict。
当模型的深度非常大的时候,使用Sequential定义模型结构需要向其中添加几百行代码,使用起来不甚方便。对于大部分模型结构,虽然模型有很多层,但其中有很多重复出现的结构。考虑到每一层有输入和输出,若干层串联成的模块也有其输入和输出。如果将这些重复出现的层定义为一个“模块”,每次只需要向网络中添加对应的模块来构建模型,这样将会极大便利模型构建的过程。
本节将U-Net为例,介绍如何构建模型块以及如何利用模型块快速搭建复杂模型。
U-Net是分割模型的杰作,通过残差连接结构解决了模型学习中的退后问题,使得神经网络的深度能够不断扩展。
模型分析:模型从上到下分为若干层,每层由左侧和右侧两个模型块组成,每侧的模型块与其上下模型块之间有连接;同时位于同一层左右两侧的模型块之间也有连接,称为‘skip-connection’。此外还有输入和输出处理等其他组成部分。
组成U-Net的模型块主要有每个子块内部的两次卷积(Double Convolution)、左侧模型块之间的下采样连接,即最大池化(Maxpooling)、右侧模型块之间的上采样连接(Up-sampling)以及输出层的处理。除模型块外,还有模型块之间的横向连接,输入和U-Net底部的连接等计算,这些单独的操作可以通过forward函数来实现。
代码实现:
- import torch
- import torch.nn as nn
- import torch.nn.functional as F
-
- class DoubleConv(nn.Module):
- # (convolution => [BN] => ReLU) * 2
-
- def __init__(self, in_channels, out_channels, mid_channels=None):
- super().__init__()
- if not mid_channels:
- mid_channels = out_channels
- self.double_conv = nn.Sequential(
- nn.Conv2d(in_channels, mie_channels, kernel_size=3, padding=1, bias=False),
- nn.BatchNorm2d(mid_channels),
- nn.ReLU(inplace=True),
- nn.Conv2d(mid_channels, out_channels, kernel_size=3, padding=1, bias=False),
- nn.BatchNorm2d(out_channels),
- nn.ReLU(inplace=True)
- )
- def forward(self, x):
- return self.double_conv(x)
-
- class Down(nn.Module):
- # Downscaling with maxpool then double conv
-
- def __init__(self, in_channels, out_channels):
- super().__init__()
- self.maxpool_conv = nn.Sequential(
- nn.MaxPool2d(2),
- DoubleConv(in_channels, out_channels)
- )
-
- def forward(self, x):
- return self.maxpool_conv(x)
-
- class Up(nn.Module):
- # Upscaling then double conv
- def __init__(self, in_channels, out_channels, bilinear=False):
- super().__init__()
-
- # if bilinear, use the normal convolutions to reduce the number of channels
- if bilinear:
- self.up = nn.Upsample(scale_factor=2, mode='bilinear', align_corners=True)
- self.conv = DoubleConv(in_channels, out_channels, in_channels//2)
- else:
- self.up = nn.ConvTranspose2d(in_channels, in_channels//2, kernel_size=2, stride=2)
- self.conv = DoubleConv(in_channels, out_channels)
-
- def forward(self, x1, x2):
- x1 = self.up(x1)
- # input is CHW
- diffY = x2.size()[2] - x1.size()[2]
- diffX = x2.size()[3] - x1.size()[3]
-
- x1 = F.pad(x1, [diffX//2, diffX-diffX//2, diffY//2, diffY-diffY//2])
- x = torch.cat([x2, x1], dim=1)
- return self.conv(x)
-
- class OutConv(nn.Module):
- def __init__(self, in_channels, out_channels):
- super(OutConv, self).__init__()
- self.conv = nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=1)
-
- def forward(self, x):
- return self.conv(x)
-
- class UNet(nn.Module):
- def __init__(self, n_channels, n_classes, bilinear=False):
- super(UNet, self).__init__()
- self.n_channels = n_channels
- self.n_classes = n_classes
- self.bilinear = bilinear
-
- self.inc = DoubleConv(n_channels, 64)
- self.down1 = Down(64, 128)
- self.down2 = Down(128, 256)
- self.down3 = Down(256, 512)
- factor = 2 if bilinear else 1
- self.down4 = Down(512, 1024//factor)
- self.up1 = Up(1024, 512//factor, bilinear)
- self.up2 = Up(512, 256//factor, bilinear)
- self.up3 = Up(256, 128//facotr, bilinear)
- self.up4 = Up(128, 64, bilinear)
- self.outc = OutConv(64, n_classes)
-
- def forward(self, x):
- x1 = self.inc(x)
- x2 = self.down1(x1)
- x3 = self.down2(x2)
- x4 = self.down3(x3)
- x5 = self.down4(x4)
- x = self.up1(x5, x4)
- x = self.up2(x, x3)
- x = self.up3(x, x2)
- x = self.up4(x, x1)
- logits = self.outc(x)
- return logins
以pytroch官方视觉库torchvision预定义好的模型ResNet50为例,探索如何修改模型的某一层或者某几层。
- import torch vision.models as models
- net = models.resnet50()
- print(net)
- ResNet(
- (conv1): Conv2d(3, 64, kernel_size=(7, 7), stride=(2, 2), padding=(3, 3), bias=False)
- (bn1): BatchNorm2d(64, eps=1e-05, momentum=0.1, affine=True, track_running_stats=True)
- (relu): ReLU(inplace=True)
- (maxpool): MaxPool2d(kernel_size=3, stride=2, padding=1, dilation=1, ceil_mode=False)
- (layer1): Sequential(
- (0): Bottleneck(
- (conv1): Conv2d(64, 64, kernel_size=(1, 1), stride=(1, 1), bias=False)
- (bn1): BatchNorm2d(64, eps=1e-05, momentum=0.1, affine=True, track_running_stats=True)
- (conv2): Conv2d(64, 64, kernel_size=(3, 3), stride=(1, 1), padding=(1, 1), bias=False)
- (bn2): BatchNorm2d(64, eps=1e-05, momentum=0.1, affine=True, track_running_stats=True)
- (conv3): Conv2d(64, 256, kernel_size=(1, 1), stride=(1, 1), bias=False)
- (bn3): BatchNorm2d(256, eps=1e-05, momentum=0.1, affine=True, track_running_stats=True)
- (relu): ReLU(inplace=True)
- (downsample): Sequential(
- (0): Conv2d(64, 256, kernel_size=(1, 1), stride=(1, 1), bias=False)
- (1): BatchNorm2d(256, eps=1e-05, momentum=0.1, affine=True, track_running_stats=True)
- )
- )
- ..............
- (avgpool): AdaptiveAvgPool2d(output_size=(1, 1))
- (fc): Linear(in_features=2048, out_features=1000, bias=True)
- )
这里模型结构是为了适配ImageNet预训练的权重,因此最后全连接层(fc)的输出节点是1000。假设要用resnet做10分类,就应该修改模型的fc层,将其输出节点数替换为10。另外,需要再加一层全连接层。
- from collections import OrderedDict
- classifier = nn.Sequential(OrderedDict([('fc1', nn.Linear(2048, 128)),
- ('relu1', nn.ReLU()),
- ('dropout1', nn.Dropout(0.5)),
- ('fc2', nn.Linear(128, 10)),
- ('output', nn.Softmax(dim=1))
- ]))
- net.fc = classifier
最后的操作相当于将模型(net)最后名称为‘fc’的层替换成了名称为‘classifier’的结构。修改后的模型可以执行10分类任务。
在模型训练中,除了已有模型的输入之后还需要输入额外的信息。基本思路是:将原模型添加输入位置前的部分作为一个整体,同时在forward中定义好原模型不变的部分、添加的输入和后续层之间的连接关系,从而完成模型的修改。
以torchvision的resnet50模型为基础,任务还是10分类的;不同点在于,利用已有的模型结构,在倒数第二层增加一个额外的输入变量add_variable来辅助预测。
- class Model(nn.Module):
- def __init__(self, net):
- super(Model, self).__init__()
- self.net = net
- self.relu = nn.ReLU()
- self.dropout = nn.Dropout(0.5)
- self.fc_add = nn.Linear(1001, 10, bias=True)
- self.output = nn.Softmax(dim=1)
-
- def forward(self, x, add_variable):
- x = self.net(x)
- x = torch.cat((self.dropout(self.relu(x)), add_variable.unsqueeze(1)),1)
- x = self.fc_add(x)
- x = self.output(x)
- return x
实现要点是通过torch.cat实现了tensor的拼接。
torchvision中的resnet50输出是一个1000维的tensor,通过修改forward函数,先将1000维的tensor通过激活函数层和dropout层,再和外部输入变量"add_variable"拼接,最后通过全连接层映射到指定的输出维度10。
另外对外部输入变量"add_variable"进行unsqueeze操作是为了和net输出的tensor保持维度一致,常用于add_variable是单一数值 (scalar) 的情况,此时add_variable的维度是 (batch_size, ),需要在第二维补充维数1,从而可以和tensor进行torch.cat操作。
之后对修改好的模型结构进行实例化
- import torchvision.models as models
- net = models.resnet50()
- model = Model(net).cuda()
训练中在输入数据的时候要给两个inputs:
outputs = model(input, add_var)
在模型训练中,除了模型最后的输出外,需要输出模型某一中间层的结果,已施加额外的监督,获得更好的中间层结果。基本思路是修改模型定义中forward函数的return变量。
- class Model(nn.Module):
- def __init__(self, net):
- super(Model, self).__init__()
- self.net = net
- self.relu = nn.ReLU()
- self.dropout = nn.Dropout(0.5)
- self.fc1 = nn.Linear(1000, 10, bias=True)
- self.output = nn.Softmax(dim=1)
-
- def forward(self, x, add_variable):
- x1000 = self.net(x)
- x10 = self.dropout(self.relu(x1000))
- x10 = self.fc1(x10)
- x10 = self.output(x10)
- return x10, x1000
之后对修改好的模型结构进行实例化,就可以使用了
- import torchvision.models as models
- net = models.resnet50()
- model = Model(net).cuda()
训练中在输入数据后有两个outputs:
out10, out1000 = model(inputs, add_var)
PyTorch模型保存与读取
模型存储格式
主要采用pkl,pt,pth三种格式。
模型存储内容
一个PyTorch模型主要包含两部分:模型结构和权重,其中模型是继承nn.module的类,权重的数据结构是一个字典(key是层名,value是权重向量)。存储分两种:存储整个模型和只存储模型权重。
- import torchvision import models
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- torch.save(model, save_dir)#保存整个模型
- torch.save(model.state_dict, save_dir)#保存模型权重
对于PyTorch而言,pt,pth和pkl三种数据格式均支持模型权重和整个模型的存储,因此使用上没有差别。
单卡和多卡模型存储的区别
PyTorch中将模型和数据放到GPU上有两种方式:.cuda()和.to(device),如果使用多卡训练的话,需要对模型使用torch.nn.DataParallel。
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0' #如果是多卡改成类似0,1,2
- model = model.cuda() #单卡
- model = torch.nn.DataParallel(model).cuda() #多卡
情况分类讨论
由于训练和测试所使用的硬件条件不同,在模型的保存和加载过程中可能因为单GPU和多GPU环境的不同带来模型不匹配等问题。这里对PyTorch框架下单卡/多卡下模型的保存和加载问题进行排列组合,样例模型是torchvision中预训练模型resnet152。
- import os, torch
- from torchvision import models
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0'#这里替换成希望使用的GPU编号
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- model.cuda()
-
- #保存+读取整个模型
- torch.save(model, save_dir)
- loaded_model = torch.load(save_dir)
- loaded_model.cuda()
-
- #保存+读取模型权重
- torch.save(model.state_dict(), save_dir)
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_model.state_dict = loaded_dict
- loaded_model.cuda()
- import os, torch
- from torchvision import models
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0'
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- model.cuda()
-
- #保存+读取整个模型
- torch.save(model, save_dir)
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '1,2'
- loaded_model = torch.load(save_dir)
- loaded_model = nn.DataParallel(loaded_model).cuda()
-
- #保存+读取模型权重
- torch.save(model.state_dict(), save_dir)
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '1,2'# 替换成希望使用的GPU编号
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
- loaded_model = models.resnet152()# 注意这里需要对模型结构有定义
- loaded_model.state_dict = loaded_dict
- loaded_model = nn.DataParallel(loaded_model).cuda()
核心问题是如何去掉权重字典键名中的“module”,以保证模型的统一性。
对于加载整个模型,直接提取模型的module属性即可
- import os, torch
- from torchvision import models
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '1,2' #这里替换成希望使用的GPU编号
-
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- model = nn.DataParallel(model).cuda()
-
- # 保存+读取整个模型
- torch.save(model, save_dir)
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0' #这里替换成希望使用的GPU编号
- loaded_model = torch.load(save_dir)
- loaded_model = loaded_model.module
对于加载模型权重,有以下几种思路:
去除字典里的module较麻烦,往model里添加module简单
- import os, torch
- from torchvision import models
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0,1,2'
-
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- model = nn.DataParallel(model).cuda()
-
- #保存+读取模型权重
- torch.save(model.state_dict(), save_dir)
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0'
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_model = nn.DataParallel(loaded_model).cuda()
- loaded_model.state_dict = loaded_dict
遍历字典去除module
- from collections import OrderedDict
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0'
-
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
-
- new_state_dict = OrderedDict()
- for k, v in loaded_dict.items():
- name = k[7:] # module字段在最前面,从第7个字符开始就可以去掉module
- new_state_dict[name] = v # 新字典的key值对应的value一一对应
-
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_model.state_dict = new_state_dict
- loaded_model = loaded_model.cuda()
使用replace操作去除module
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
- loaded_model.load_state_dict({k.replace('module.',''): v for k, v in loaded_dict.items()})
由于是模型保存和加载都使用的是多卡,因此不存在模型层名前缀不同的问题。但多卡状态下存在一个device(使用的GPU)匹配的问题,即保存整个模型时会同时保存所使用的GPU id等信息,读取时若这些信息和当前使用的GPU信息不符则可能会报错或者程序不按预定状态运行。具体表现为以下两点:
读取整个模型再使用nn.DataParallel进行分布式训练设置
这种情况很可能会造成保存的整个模型中GPU id和读取环境下设置的GPU id不符,训练时数据所在device和模型所在device不一致而报错。
读取整个模型而不使用nn.DataParallel进行分布式训练设置
这种情况可能不会报错,测试中发现程序会自动使用设备的前n个GPU进行训练(n是保存的模型使用的GPU个数)。此时如果指定的GPU个数少于n,则会报错。在这种情况下,只有保存模型时环境的device id和读取模型时环境的device id一致,程序才会按照预期在指定的GPU上进行分布式训练。
相比之下,读取模型权重,之后再使用nn.DataParallel进行分布式训练设置则没有问题。因此多卡模式下建议使用权重的方式存储和读取模型:
- import os, torch
- from torchvision import models
-
- os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0,1,2'
-
- model = models.resnet152(pretrained=True)
- model = nn.DataParallel(model).cuda()
-
- #保存+读取模型权重,强烈建议!!
- torch.save(model.state_dict(), save_dir)
- loaded_dict = torch.load(save_dir)
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_model = nn.DataParallel(loaded_model).cuda()
- loaded_model.state_dict = loaded_dict
如果只有保存的整个模型,也可以采用提取权重的方式构建新的模型:
- #读取整个模型
- loaded_whole_model = torch.load(save_dir)
- loaded_model = models.resnet152()
- loaded_model.state_dict = loaded_whole_model.state_dict
- loaded_model = nn.DataParallel(loaded_model).cuda()
另外,所有对于loaded_model修改权重字典的形式都是通过赋值来实现的,在PyTorch中还可以通过“load_state_dict”函数来实现:
loaded_model.load_state_dict(loaded_dict)
附:测试环境 OS: Ubuntu 20.02 LTS GPU: GeForce RTX 2080 Ti(x3)
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