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第8章:命名实体识别——手动标注BIO_命名实体识别bio标注

命名实体识别bio标注

手动数据标注+BIO标注

原数据:

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任务1:将一句话认为是一个txt文档

import os

raw_data_path = './data/raw_data.txt'

save_folder = './data/biaozhushuju'
if not os.path.exists(save_folder):
	os.makedirs(save_folder)

with open(raw_data_path,'r',encoding='utf8') as f:
	for i,line in enumerate(f.readlines()):
		line = line.strip()  #strip()表示删除掉数据中的换行符

		with open(os.path.join(save_folder,'%s.txt' % str(10000+i)),'w',encoding='utf8') as fo:  #os.path.join()函数用于路径拼接文件路径,可以传入多个路径
			fo.write(line)
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任务2:利用标注软件对txt文档进行标注

2.1BRAT标注(运行于Linux系统中)
2.2精灵标注助手(运行于Win系统)

任务3:将标注后的ann文件和原数据进行BIL标注

import glob
def bratann2BIO_format(text,ann_str,fstream):
   #将每一行的元素变为list,strip()删除的字符,按照split()中的符号进行每行元素分割为list的元素
  ann_list = ann_str.strip().split('\n')
  
  
  label = ['O' for _ in range(len(text))] #对所有的文字赋值为标签"O"
  for i,line in enumerate(ann_list): #enumerate函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标   
    try:
        #line:T1    疾病 4 7  高血压
      T,typ,word = line.strip().split('\t') 
      t,s,e = typ.split() #分别t=疾病 s=起始位置下标 e=结束位置
      s,e = int(s),int(e)
      label[s] = 'B-'+t
      while s < e-1:
        s += 1
        label[s] = 'I-'+t
    except:
      continue
   
  for t,l in zip(list(text),label):  #list() 构造函数在 Python 中返回一个列表,将文本以字切分为列表
      #str.join(item1,itemm2),join函数是一个字符串操作函数,使用str符号将item1和item2串联起来
      line = ' '.join([t,l])
      print(line)
      fstream.write(line)
      fstream.write('\n') #每一个文本(一行)写完,然后进行换行
   stream.write('\n') #使用换行符,将每一个文本用一个空行分开,在train.txt文档中可以很清晰的看到句与句的切分

def gen_NER_training_data():
  # 设置标注文件所在文件夹目录
  root_dir = './data/biaozhushuju/outputs'
  # 设置训练样本输出文件路径
  stream = open('./data/train.txt','a+',encoding='utf8')
  # ann:E:\工作空间\NER-data-process\data\biaozhushuju\outputs\10000.ann
  # txt:E:\工作空间\NER-data-process\data\biaozhushuju\10000.txt
  file_list = glob.glob(root_dir+'/*.ann')  #glob.glob() 函数的作用:在一个文件中,要遍历所有的文件内容

  for ann_path in file_list:
      #转换路径:转换前:'./data/biaozhushuju/outputs\\10000.ann'
     # 转换为:'./data/biaozhushuju/outputs/10000.ann'
    ann_path = ann_path.replace('\\','/') 
   # 获得txt路径
    txt_path = ann_path.replace('/outputs','').replace('ann','txt') #将biaozhushuju取消,然后使用txt替换掉ann
    
    try:
      ft = open(txt_path,'r',encoding='utf8')
      text = ft.read().strip()
      ft.close()
      fa = open(ann_path,'r',encoding='utf8')
      ann = fa.read().strip()
      fa.close()
      if ann == '':
        continue
      bratann2BIO_format(text,ann,stream)
    except Exception as e:
      print(ann_path,e)
      
  stream.close()

if __name__ == '__main__':
  gen_NER_training_data()
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标注结果:

在这里插入图片描述

参考:https://www.bilibili.com/video/BV1ft4y1g7s7/?spm_id_from=333.337.search-card.all.click

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