3D Slicer5.3在win11下的源码编译安装_3d slicer软件 开发

0. 前言

本博客主要参考官方安装文档
以及部分CSDN的博客，部分内容的书写会直接参考官方文档的内容。


同时，如果遇到了一些匪夷所思且完全找不到方向的报错，可以尝试去社区搜索相关报错或者提问，开发者们都比较活跃。
这是社区

 Slicer依赖于一些大型的第三方库，例如VTK、ITK和DCMTK，构建时间很长，占用空间较大，笔者使用的的Debug模式进行构建，使用了60G的磁盘空间，如果需要进行后续开发，建议准备更多的磁盘空间。
 根据官方文档所写，在台式机电脑上预计花费3-4小时，在笔记本电脑上可能会花费8-12小时（不同配置可能会有差距）。
 项目整体极其庞大，解决方案和子项目众多，笔者的构建文件夹中总共有接近20w个文件。

1. 准备

1.1 环境

笔者所用的相关配置如下：

• Windows11 22H2 x64
• Windows SDK 22000
• Git 2.38.1
• Cmake 3.26.0

在七月的源码cmakelists中，cmake版本3.21.0和CMake >=3.25.0,<=3.25.2的版本不受支持，请选择其他版本的cmake。
否则可能会报错FATAL_ERROR "CMake version is 3.21.0 and using CMake==3.21.0 is not supported.
这个不是固定的，需要根据你源码里所提示的进行更换cmake版本。

• QT 5.15.2 （必须包含的组件有：MSVC2019 64-bit，Qt Script ， Qt WebEngine）

官方的python脚本翻译需要Qt6.3.0及以上版本，截至目前还没完全启用。
Linux需要5.12版本的QT

• Visual Studio 2022（需要包含C++桌面开发、v143工具集组件）

VS2019的v142工具集官方没有测试，但是通过其他博客看来，可能仍然有效果

1.2 注意事项

1.  与常见的另一款工具ITK-SNAP不同，ITK-SNAP在构建之前需要对依赖的库例如CURL,VTK,OpenCV,ITK进行单独的构建，然后在ITK-SNAP本体进行configure的时候链接到相关的库；
   而Slicer的源码中，在其源码的子文件夹 \SuperBuild 里已经包含了自身依赖的库，这也是Slicer源码构建工程庞大的原因。
   
   

2.  Slicer是基于python和C++开发的，在构建的过程中也会用到python的库，但是正如上面提到，Slicer自身包含了相关依赖，这个包含也包括了Python在内，所以构建过程中，如果主机本体在其他位置也有python环境，可能导致构建时候错误调用，没有使用到Slicer自身需要的python环境。所以，请在构建的过程中删除环境变量中的有关python的所有引用，或者对其他python暂时性的重命名。
   
   

3.  需要准备科学上网的方式，前面提到，Slicer整体大项目是会自己构建自己需要依赖的库，所以Slicer会去github上自行下载相关依赖的源码，而你需要为其准备一个稳定的网络环境，并且最好打开全局模式，如果你使用的是Clash，最好还要打开TUN mode。从网络上的博客来看，绝大部分问题都是网络问题，所以可以反复进行构建，直到剩下构建失败的项目不再变化。
    值得一提的是，在构建到最后的时候，还需要关闭一下科学上网，因为当需要从github拉取的操作完成后，后续还会通过Slicer的python进行pip安装一些相关库，而这个过程如果有代理很可能会导致失败。

   
   

1.3 配置文件夹

 需要新建一个文件夹作为源码目录，然后在源码目录下或者同级目录新建build文件夹。
 样例：
源码文件夹：D:\S\Src
编译文件夹：D:\S\Bd


注意：

• 路径名不要太长，使用尽量少的字符；

三到四级深的目录后续可能会报错字符长度超过250个。

• 不建议在路径名中包含空格字符；
• 如果要分别构建Release模式和Debug模式的Slicer，源码目录相同，而编译目录最好进行区分，可以为Build-R和Build-D；

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2. 编译

源码

 建议直接拉取Github的源码进行编译，据说直接下载源码编译会在最后编译的时候报错。
将源码拉取到前文创建的源码目录：D:\S\Src（请根据实际情况修改，本文的两个目录路径都只作为演示）
这是拉取命令：

git clone https://github.com/Slicer/Slicer.git .
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 注意命令末尾的点不能省去，如果省去的话git会在当前目录中额外创建一个slicer子文件夹。

CMake配置

1.  源码路径(where is the source code)和编译路径(where to build the binaries)根据自己所命名的路径进行选择：

2.  路径配置完成后，在Cmake中点击add entry，新建一个Qt5_DIR，类型为PATH，具体指向你个人的QT安装路径下的该文件夹：

$QT_INSTALL_PATH$/Qt5.15.2/5.15.2/msvc2019——64/lib/cmake/Qt5
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路径需要根据自己的实际QT路径情况进行修改。

3. 如果需要在Release模式构建，有两种处理方法：
    - 在最后Visual Studio进入解决方案（slicer.sln）后，在顶部栏中选择Release即可。
    - 在CMake中，把参数CMAKE_CONFIGURATION_TYPES修改为只有Release的形式，这个方案可以很大程度规避一些人为遗忘导致的错误勾选Debug模式。

4.  路径和参数都添加完毕后，点击Configure，配置选择Visual Studio 17 2022和x64平台，

5.  多次configure直到没有红色的参数出现，点击Generate生成解决方案，然后点击Open Project打开该解决方案。

• 一个问题：
   在部分博客中提到了cmake的时候会出现一个报错，报错文件是CMake\SlicerCheckCMakeHTTPS.cmake，文件中有个url是"https://raw.githubusercontent.com/Slicer/Slicer/main/CMakeLists.txt" ，可以改为国内能自由访问的网址如"www.baidu.com" 。确实可以这样来规避此问题，亲测有效。
   不过我自己是使用科学上网，这样也可以成功解决该问题。此外，如果开启科学上网依然没有解决，可以尝试打开全局模式，或者关闭wifi重新开启。
  （网络类型的错误还是得多尝试）

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3. Visual Studio

 进去解决方案，直接生成ALL_BUILD项目，然后就开始等待了。（该过程会比较漫长）
 在该部分遇到的部分问题可以参考下文的 VS中问题汇总

启动项目

 当前的sln项目所在的目录，是我们的build目录，其中包含特别多的子解决方案，包括CTK、ITK、DCMTK、VTK、CURL等，也包括了一个名为Slicer的子解决方案，路径为build\Slicer-build\Slicer.sln，打开这个子解决方案，就可以看到Slicer的源码了。
正确的打开方式应该是：
通过终端进入当前的build目录，即D:\S\Bd

cd Slicer-build
./Slicer.exe --VisualStudioProject
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通过命令打开的VS，才能正确的运行slicer软件。
进入VS后也可以先找到All Build进行一次生成，没有报错后再修改启动项。（这一步不是必须的，如果后期项目源码有修正，可以使用这一步）

 在这个解决方案中，选择左侧的App-Slicer文件夹，将里面的SlicerApp设置为启动项，然后运行项目，就可以成功启动Slicer了，同样，在$Build$\Slicer-build\Slicer.exe也可以启动Slicer。

VS中问题汇总

• 在错误列表中显示的报错可能较多而且不好定位问题所在，可以在输出中，搜索关键词error，挨着查找输出给出的错误，能够查看输出的错误详细信息。

•  在ALL Build的过程中，你能在输出标签栏看到一些在github上的拉取操作，如果反复提醒你连接失败，可能是没有科学上网，没有开启全局模式或者TUN模式，确保你的VS能够正常访问github（光浏览器可以访问还不够）。保证成功开启科学上网。

•  当没有github的拉取操作后，还是有项目生成失败，在错误中可能会发现python-\*命名的项目生成失败了，可能能发现是在调用PythonSlicer.exe执行-m pip install相关操作失败了，这时候就关闭科学上网，笔者是因为在自身的代理环境下，python没法访问相关的镜像去下载库，所以导致了失败。

•  CTK的MSB8066报错：

1. 在目录\build下能看到一个名为CTK_build的目录，在这个位置新建一个CTK_install文件夹，注意是和CTK_build同级


2. 然后用Cmake-gui去打开CTK_build，将参数CMAKE_INSTALL_PREFIX的值修改为刚刚创建的CTK_install文件夹的路径，然后再configure和generate解决方案，接着open project打开解决方案，在VS中生成ALL_BUILD


3. 在生成CTK的ALL_BUILD时候可能会在项目PythonQt报错，还是用cmake-gui打开build\CTK_build\PythonQt_build，不用修改，configure和generate解决方案，接着open project打开解决方案，在VS中生成ALL_BUILD，最后生成INSTALL项目来安装PythonQt


4. 再次回到CTK解决方案中，生成ALL_BUILD，编译完成后INSTALL就行。


5. 最后再次回到Slicer中，生成ALL_BUILD

• CTK项目gbk error
  报错了一个这个问题，检索error发现是和gbk编码相关的，这个就直接去对应的文件去修改该问题。
  找到报错的文件路径：build\CTK\CMake\ctkWrapPythonQt.py，文件第92行：
  

添加内容encoding = "utf-8"，然后再进行ALL_BUILD就没问题了。

• 进入软件后，插件界面不加载
  SPKC
  在这个网站去找有效的版本号。

尽量避开在早上构建Slicer，看意思在欧美时间的夜晚可能构建的night版本加载不出来扩展

 这个问题在cmakelists.txt里面能看到，这个version版本号和你的拉取有关，当我自己复刻了仓库并自行提交了几个更改后，再进行拉取，我的版本号直接快了拉取官方的构建好几个版本，比如我自己构建的时候官方的版本号是31876，我拉取下来是31877，官方次日更新到31878，我自行修改后，版本号变成了31885。
SPKC上压根没有我自己修改后生成的版本号，所以我在cmakelists里强制修改了我的版本号。
方法就是改变根目录cmakelists.txt文件中的参数slicer_forced_revision的值，我强制设定为了31878，之后重新编译就可以正常访问了。

#set(Slicer_FORCED_REVISION "" CACHE STRING "Overwrite value of automatically set Slicer_REVISION")
set(Slicer_FORCED_REVISION "31878")
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截止博客撰写时间，最新的版本号是32900

4. 该博客更新日志

23-07更新：
7月再次用源码构建了Slicer，在这几个月中也重复构建了几次，这里会更新一些版本的相关问题，例如cmake的版本要求又发生了变化。
之前构建完成后经常出现扩展页面空白的情况，现在勉强搞清楚了原因。

24-06更新：
补充了几个细节问题，完善了整体的构建流程。例如命令行打开slicer-build项目。