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CAMELYON16 百度NCRF肿瘤识别算法如何在最新环境下调通_openslide.lowlevel.openslideunsupportedformaterror

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最近对病理切片的识别和检测算法突然有点兴趣,就想着去GitHub上看看有没有相关算法可以学习。经过搜索后,发现baidu-research的NCRF开源算法,标星600多,还有相关论文,效果嘛倒也不错,于是决定就是它了。

 

先来看看依赖, python3.6,numpy1.14.3,pytorch0.3.1。看到这里笔者心头一凉,如果没记错的话pytorch已经发布1.5稳定版了,这个0.3.1会不会有什么坑啊,不管了,先把最新版本的装起来看看报什么错再说吧。

 第一步先准备数据,按照给定的链接打开CAMELYON16的比赛网站,发现数据要去CAMELYON17的主页上获取,心里顿时没了底,这数据到底还下不下的到呢?还好,在网站上提供了百度网盘的下载方式,点进去也发现文件还在。不过这里不得不吐槽一下不开会员的这个下载速度,700G的数据几KB的速度,不得已只能冲个会员了。

等代码和数据都上传到服务器已经一天过去了。下面正式来到代码调试阶段,第一步是Patch images。输入以

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