代谢组数据分析六：其他分析

Other Analysis {#OtherAnalysis}

除了常见的功能分析，还有其他的功能分析方法或R包。本章节主要介绍其他功能分析的方法以及结果解析。

所需要的数据：链接: https://pan.baidu.com/s/1xezhpZRebCsct0AtlDpSHg 提取码: 2djy

FELLA: an R package to enrich metabolomics data

FELLA（[@picart2018fella]）发表于2018年，现谷歌引用67次，它是一个专门用于代谢组通路分析的R包。

基于前期分析得到的差异代谢物来构建基于网络的富集分析。结果包括代谢通路、模块、酶、反应及代谢物。那么除了能够提供通路列表，FELLA还能够生成输入代谢物相关的中间物质（如模块、酶、反应）。可以反映特定研究条件下代谢通路之间的交集以及靶向潜在的酶和代谢物。

它包含了以下三步：

1. Block I: local database从数据库抓取数据后，将其处理转存在本地；

2. Block II: enrichment analysis将关心的代谢物作为输入，做富集分析；

3. Block III: exporting results导出数据。

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