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热图展示参与者的属性,散点图表示样本的时间跨度。
library(tidyverse)
library(ComplexHeatmap)
library(circlize)
library(cowplot)
数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):
百度云盘链接: https://pan.baidu.com/s/1iEE9seTLdrrC3WDHJytvIQ
提取码: yvf5
load("figure1ab.RData")
tumortype_order <- tmn_meta_data$dx1_tumortype %>%
table %>% sort %>% names
patient_order <- with(tmn_meta_data, setNames(dx1_tumortype, upn)) %>%
.[order(match(., tumortype_order))] %>% names
tmn_meta_data_processed <- tmn_meta_data %>%
mutate(upn = factor(upn, l
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