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iMeta微生物组工具集专刊征稿:生物信息学、生物技术和宏组学方法

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微生物组工具集专刊征稿:生物信息学、生物技术和宏组学方法

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微生物组是栖息在肠道、土壤和水生生态系统等不同环境中的复杂微生物群落,在生态系统功能、宿主健康和生物技术应用中发挥着重要作用。计算生物学、生物信息学工具、宏基因组学和组学分析的进步以及测序技术的创新推动了微生物组研究的蓬勃发展。

自iMeta推出以来,我们发表了一系列相关文章,引起了研究界的高度关注,目前平均被引用次数为 31.6 次。最近,我们建立了一个虚拟专刊,其中包含这些文章的精选集,可以通过以下链接访问:微生物组工具集:生物信息学、生物技术和宏组学方法(https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)2770-596X.bioinformatics-biotechnology-metaomics)。与此同时,我们借此机会来鼓励更多人致力于推动这一领域的发展。

我们目前的论文征集旨在探索微生物组研究的多维度及其在各个领域的影响。我们邀请研究人员就以下主题贡献他们的方法、实验室指南、评论、原创研究和观点,包括但不限于:

● 计算生物学方法阐明了肠道、土壤和不同环境生态位中微生物组的动态和功能。

● 开发和应用专门用于分析微生物组数据的生物信息学工具,促进对微生物群落结构、相互作用和功能的全面了解。

● 用于宏基因组和整合多组学数据分析的新策略和计算流程或工作流程,以揭示不同生态系统中的微生物多样性、功能潜力和生态动态,为创新生物技术应用铺平道路。

● 探索新的测序技术和分析方法,以前所未有的分辨率分析微生物组,从而更深入地了解微生物群落的组成和功能。

我们鼓励微生物学、生态学、生物信息学、计算生物学和生物技术等学科的研究人员做出贡献。

与我们一起推进微生物组研究的前沿,塑造这个快速发展领域的未来!

专刊链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/page/journal/2770596x/homepage/call-for-papers/si-2024-000260

投稿截止日期2025 年 3 月 31 日星期一

客座编辑

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南京大学生科院

陈迪俊

副教授

陈迪俊,南京大学副教授、博士生导师,江苏省特聘教授、南京大学登峰B人才支持计划入选者。2003-2008年在哈尔滨医科大学接受本科教育并获得生物信息学学士学位,2017年在德国哈雷-维滕贝格大学获得博士学位,先后在浙江大学、波茨坦大学和洪堡大学从事研究工作,2019年底入职南京大学,担任生物信息学课题组PI,主要研究方向是基因转录调控的生物信息学研究。共发表学术论文近60篇,参与编写专著5部,其中以第一或者通讯(含共同)作者在Nat Commun (5篇)、Nat Neurosci、Nat Plants、iMeta等期刊发表论文30余篇。

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中科院深圳先进技术研究院

陈实富

正高级工程师/客座研究员

中科院博士,正高级工程师,海普洛斯集团创始人兼首席技术官,中科院深圳先进技术研究院客座研究员。2019年深圳市青年科技奖获得者,获评2022广东省创新达人,以项目负责人获2022深圳科技进步奖。开源项目组OpenGene的发起人,多款热门生物信息学软件的作者。发表国际期刊和会议论文60余篇,其中一作兼通讯最高单篇引用超过8000次。申请30余项发明专利和40多项软件著作权,是中国抗癌协会、中国临床肿瘤学会以及美国肿瘤学会会员,中国抗癌协会肿瘤标志专委会青年委员,肿瘤测序及大数据分析专委会委员。

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兰州大学生态学院

张东

研究员

张东,兰州大学生态学院/西藏大学理学院青年研究员。于2020年博士毕业于中国科学院水生生物研究所,现主要从事鱼类寄生虫的分子系统发育、寄生虫与宿主的协同进化等方面的研究工作,并开发了相关的分析工具,在Molecular Ecology、Molecular Phylogenetics and Evolution、Molecular Ecology Resources、International Journal for Parasitology等生态学、进化生物学、寄生虫学领域的国际知名期刊上发表SCI论文40余篇,1篇入选ESI高被引论文,累计被引1600余次。

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浙江大学生命科学研究院

蒋超

研究员

蒋超,浙江大学生命科学研究院研究员,博士生导师,兼聘浙江大学附属第一医院。博士毕业于美国印第安纳大学并在斯坦福大学医学院遗传系精准医学中心进行博士后研究。长期致力于环境暴露组、微生物组、演化微生物、精准医学以及相关的实验和生信方法学开发等研究。已在国际知名期刊Cell、Nature、Nature Protocols、Cell Discovery、mSystems、Nature Biotechnology、Circulation Research、Genome Research、Journal of Hazardous Materials、mBio等杂志发表多篇研究论文。目前为Frontiers in Microbiology客座编辑、iMeta青年编辑和Bio-protocol编辑。

关键词

计算机生物学、生物信息学、肠道微生物组、宏基因组学、测序技术

提交指南/说明

参考作者指南,所有提交的稿件都将经过iMeta严格的同行评审过程,以确保科学性的卓越性和与主题的相关性。提交稿件时,从下拉列表中选择特刊标题“Microbiome Toolbox”回答以下问题:“Is this submission for a special issue?” 

请注意,2025 年 1 月 1日之前提交的 APC 可以豁免;对于在此之后提交稿件的作者,将需要缴纳 APC。

如需投稿帮助,请联系:  office@imeta.science

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1卷1期

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1卷2期

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1卷3期

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1卷4期

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2卷1期

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2卷2期

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2卷3期

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2卷4期

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3卷1期

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2卷2期封底

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2卷4期封底

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3卷2期

期刊简介

“iMeta” 是由威立、肠菌分会和本领域数百位华人科学家合作出版的开放获取期刊,主编由中科院微生物所刘双江研究员和荷兰格罗宁根大学傅静远教授担任。目的是发表原创研究、方法和综述以促进宏基因组学、微生物组和生物信息学发展。目标是发表前10%(IF > 20)的高影响力论文。期刊特色包括视频投稿、可重复分析、图片打磨、青年编委、50万用户的社交媒体宣传等。2022年2月正式创刊发行!目前期刊已经被ESCI、Scopus等数据库收录。

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iMeta主页:http://www.imeta.science

出版社:https://onlinelibrary.wiley.com/journal/2770596x
投稿:https://mc.manuscriptcentral.com/imeta
邮箱:office@imeta.science

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