分子对接（docking）完整流程_分子docking怎么做

作者：神奇cpp | 2024-08-11 20:45:42

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分子docking怎么做

1、准备蛋白质的受体的pdb文件、config信息

情况一：smiles文件

smiles --> pdb

直接利用：F:\pythonProject\Pycharm_workspace\gypsum_dl-1.2.0\smiles2pdb_sdf.py

即可将smiles转为pdb文件

情况二：sdf文件：

直接进行下一步

情况三：pdb文件：

直接进行下一步

pdb --> pdbqt

直接利用：F:\pythonProject\Pycharm_workspace\gypsum_dl-1.2.0\docking\pdb2pdbqt.py

使用unidock进行对接

直接利用：D:\Pycharm_workspace\MolImageGeneration\Uni-Dock\run_dock_new.py

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