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孟德尔随机化在线分析后再本地分析的理由之一_孟德尔随机化 数据 本地

孟德尔随机化 数据 本地

孟德尔随机化在线分析后再本地分析的理由之一

刚开始学MR的时候觉得这是一片蓝海,随着学习的深入发现越坑越惨~

时间主要花在两方面:

  1. 找不重复的队列,这件事情居然是需要去原文找,以及推理的。
  2. endless 502.503…

我曾经在线分析成功过一对。后来老师叫下载本地数据再分析。不知道为什么,就只管去做。

但是找的过程发现艰难无比,过程繁琐细碎不说,很多GWAS数据都meta过finn和ukb的数据。这样的话,按数据库总结数据就变得useless and helpless了。更确切的需求是按队列总结数据。很难找的。既然在线分析成功过,再把在线分析的数据集下载到本地再run一下不久好了!

于是我找回当初在线分析的数据集,是有 api 接口的。
在这里插入图片描述

下载下来一看,居然,跟本地下载的一样,MR分析必备数据是凑不齐的。
在这里插入图片描述So ?

每个坑栽下去,都要好久才能爬出来!

有的操作,老师不会事无巨细的跟你讲,但是存在即合理,努力去做!

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