miniconda安装，及channels配置，安装其他软件_miniconda channel

在使用linux中，经常会遇到安装软件，配置环境的问题，有一种偷懒的方式，就是使用第三库进行安装，就是类似于在windows下使用软件管家安装软件，这样做最大的便利在于不需要去配置很多的依赖环境
1、下载miniconda

wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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**2、安装**
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
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回车，yes，写上相应的路径（注意miniconda文件夹不能存在）

出现下面的情况，即安装完成

3、这时候需要激活一下环境，
source ~/.bashrc
4、查看conda安装了哪些软件

conda list
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5、添加channels（可以任意选择）

#国外
conda config --add channels r
conda config --add channels defaults
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
#国内
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
#中国科技大学的源
conda config --add channels http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
#上海交通大学的源
conda config --add channels http://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels http://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels http://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
#
conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels biobakery
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当然如果想要删除channels，也可以执行下面的命令
移除channels

conda config --remove channels +名称
查看所有channels
conda config --get channels
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6、安装软件
conda install 软件（如R）
后面会问需要安装吗？直接输入y
当然也可以直接输入

conda install -y r-base
conda install -c bioconductor r-base
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#bioconductor是特定的库进行安装，这样搜索的过程会快很多
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7、当遇到软件相互不兼容，或者是一个软件需要安装多个版本的情况，该怎么处理呢？
可以创建一个新的环境，类似于新建了一个容器，用于放置这些软件
如创建tf2的环境存放python2

conda create -n tf2 python=2.7
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#激活tf2环境
conda activate tf2
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#查看所有环境

conda env list
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#退出tf2环境
conda deactivate
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激活什么环境，就自己加载了相应的环境，便可以自动使用了
#该过程省去了配置路径的过程。
8、当使用root权限安装软件后，其他用户怎么使用呢？

#输入 which R
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可以直接使用绝对路径进行使用，当然这种方式很麻烦，有时候会记不住路径，我们可以将这个绝对路径加入到.bashrc中。

仿照这样的形式去写，然后

source ~/.bashrc
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