复刻一篇论文中蛋白质结构预测过程1_hhpred

作者：Li_阴宅 | 2024-06-25 22:38:25

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hhpred

根据“黑曲霉 α-L-鼠李糖苷酶 Rha1 的二级结构预测及三级结构模拟”一文，复刻由氨基酸序列预测蛋白质结构的过程

1. 获取氨基酸序列数据

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/511775221/?report=genbank

检查一下长度

为655，正确

2. 二级结构分析

蛋白质序列网络分析 Network Protein Sequence @nalysis ( http://www.bioinf. manchester.ac.uk/dbbrowser/bioactivity/NPS2.html)
选择九个二级结构在线分析方法 DPM，DSC，GORI，GORIII，HNN， MLRC，PHD，SOPM，Predator

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