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scipy.optimize
中,curve_fit
函数可调用非线性最小二乘法进行函数拟合,例如,现在有一个高斯函数想要被拟合
y = a exp − ( x − b c ) 2 y = a\exp-(\frac{x-b}{c})^2 y=aexp−(cx−b)2
则调用方法如下
import numpy as np
from scipy.optimize import curve_fit
def gauss(x, a, b, c):
return a*np.exp(-(x-b)**2/c**2)
x = np.arange(100)/10
y = gauss(x, 2, 5, 3) + np.random.rand(100)/10
# 非线性拟合 abc为参数;para为拟合评价
abc, para = curve_fit(gauss, x, y)
print(abc)
# [2.03042233 5.01182397 3.10994351]
其中,curve_fit
在调用时输入了三个参数,分别是拟合函数、自变量、因变量。返回值abc
和para
分别为拟合参数和拟合的协方差,最终得到abc
的值与预设的2,0.5, 3
是比较接近的,其拟合效果可以画图查看一下
import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(x, y, marker='.')
Y = gauss(x, *abc)
plt.plot(x, Y, lw=1)
plt.show()
效果如下
curve_fit
的装形式如下
curve_fit(f, xdata, ydata, p0=None, sigma=None, absolute_sigma=False, check_finite=True, bounds=(-inf, inf), method=None, jac=None, *, full_output=False, **kwargs)
除了f, xdata, ydata
已经用过之外,其他参数的含义为
最小二乘函数:least_squares
尽管curve_fit
的参数列表中,只给出了xdata, ydata
作为拟合参数,而xdata
只有一组,但curve_fit
是具备多元拟合潜力的。
唯一需要注意的是,当多元拟合函数的返回值必须为一维数组,示例如下
# 创建一个函数模型用来生成数据
def func1(x, a, b, c, d):
r = a * np.exp(-((x[0] - b) ** 2 + (x[1] - d) ** 2) / (2 * c ** 2))
return r.ravel()
# 生成原始数据
xx = np.indices([10, 10])
z = func1(xx, 10, 5, 2, 5) + np.random.normal(size=100)/100
abcd, para = curve_fit(func1, xx, z)
print(abcd)
# [10.00258587 5.00146314 1.99952885 5.00138184]
可以发现拟合结果与预设的abcd
还是比较接近的,下面绘制三维图像来更加直观地查看一下
z = z.reshape(10, 10)
Z = func1(xx, *abcd).reshape(10,10)
ax = plt.subplot(projection='3d')
ax.scatter3D(xx[0], xx[1], z, color='red')
ax.plot_surface(xx[0], xx[1], Z, cmap='rainbow')
plt.show()
结果如下
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