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两种列式存储格式:Parquet和ORC,2024阿里手淘Python面试题目_parquet和orc是如何支持嵌套数据格式的

parquet和orc是如何支持嵌套数据格式的

通过Striping/Assembly算法,parquet可以使用较少的存储空间表示复杂的嵌套格式,并且通常Repetition level和Definition level都是较小的整数值,可以通过RLE算法对其进行压缩,进一步降低存储空间。

文件结构


Parquet文件是以二进制方式存储的,是不可以直接读取和修改的,Parquet文件是自解析的,文件中包括该文件的数据和元数据。在HDFS文件系统和Parquet文件中存在如下几个概念:

  • HDFS块(Block):它是HDFS上的最小的副本单位,HDFS会把一个Block存储在本地的一个文件并且维护分散在不同的机器上的多个副本,通常情况下一个Block的大小为256M、512M等。

  • HDFS文件(File):一个HDFS的文件,包括数据和元数据,数据分散存储在多个Block中。

  • 行组(Row Group):按照行将数据物理上划分为多个单元,每一个行组包含一定的行数,在一个HDFS文件中至少存储一个行组,Parquet读写的时候会将整个行组缓存在内存中,所以如果每一个行组的大小是由内存大的小决定的。

  • 列块(Column Chunk):在一个行组中每一列保存在一个列块中,行组中的所有列连续的存储在这个行组文件中。不同的列块可能使用不同的算法进行压缩。

  • 页(Page):每一个列块划分为多个页,一个页是最小的编码的单位,在同一个列块的不同页可能使用不同的编码方式。

通常情况下,在存储Parquet数据的时候会按照HDFS的Block大小设置行组的大小,由于一般情况下每一个Mapper任务处理数据的最小单位是一个Block,这样可以把每一个行组由一个Mapper任务处理,增大任务执行并行度。Parquet文件的格式如下图所示。

Parquet文件结构

图4 Parquet文件结构

上图展示了一个Parquet文件的结构,一个文件中可以存储多个行组,文件的首位都是该文件的Magic Code,用于校验它是否是一个Parquet文件,Footer length存储了文件元数据的大小,通过该值和文件长度可以计算出元数据的偏移量,文件的元数据中包括每一个行组的元数据信息和当前文件的Schema信息。除了文件中每一个行组的元数据,每一页的开始都会存储该页的元数据,在Parquet中,有三种类型的页:数据页、字典页和索引页。数据页用于存储当前行组中该列的值,字典页存储该列值的编码字典,每一个列块中最多包含一个字典页,索引页用来存储当前行组下该列的索引,目前Parquet中还不支持索引页,但是在后面的版本中增加。

数据访问


说到列式存储的优势,Project下推是无疑最突出的,它意味着在获取表中原始数据时只需要扫描查询中需要的列,由于每一列的所有值都是连续存储的,避免扫描整个表文件内容。

在Parquet中原生就支持Project下推,执行查询的时候可以通过Configuration传递需要读取的列的信息,这些列必须是Schema的子集,Parquet每次会扫描一个Row Group的数据,然后一次性得将该Row Group里所有需要的列的Cloumn Chunk都读取到内存中,每次读取一个Row Group的数据能够大大降低随机读的次数,除此之外,Parquet在读取的时候会考虑列是否连续,如果某些需要的列是存储位置是连续的,那么一次读操作就可以把多个列的数据读取到内存。

在数据访问的过程中,Parquet还可以利用每一个row group生成的统计信息进行谓词下推,这部分信息包括该Column Chunk的最大值、最小值和空值个数。通过这些统计值和该列的过滤条件可以判断该Row Group是否需要扫描。另外Parquet未来还会增加诸如Bloom Filter和Index等优化数据,更加有效的完成谓词下推。

ORC文件格式

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ORC文件格式是一种Hadoop生态圈中的列式存储格式,它的产生早在2013年初,最初产生自Apache Hive,用于降低Hadoop数据存储空间和加速Hive查询速度。和Parquet类似,它并不是一个单纯的列式存储格式,仍然是首先根据行组分割整个表,在每一个行组内进行按列存储。ORC文件是自描述的,它的元数据使用Protocol Buffers序列化,并且文件中的数据尽可能的压缩以降低存储空间的消耗,目前也被Spark SQL、Presto等查询引擎支持,但是Impala对于ORC目前没有支持,仍然使用Parquet作为主要的列式存储格式。2015年ORC项目被Apache项目基金会提升为Apache顶级项目。

数据模型


和Parquet不同,ORC原生是不支持嵌套数据格式的,而是通过对复杂数据类型特殊处理的方式实现嵌套格式的支持,例如对于如下的hive表:

CREATE TABLE orcStructTable(

name string,

course structcourse:string,score:int,

score map<string,int>,

work_locations array)

  • 1

  • 2

  • 3

  • 4

  • 5

ORC格式会将其转换成如下的树状结构:

Parquet的schema

图5 ORC的schema结构

在ORC的结构中这个schema包含10个column,其中包含了复杂类型列和原始类型的列,前者包括LIST、STRUCT、MAP和UNION类型,后者包括BOOLEAN、整数、浮点数、字符串类型等,其中STRUCT的孩子节点包括它的成员变量,可能有多个孩子节点,MAP有两个孩子节点,分别为key和value,LIST包含一个孩子节点,类型为该LIST的成员类型,UNION一般不怎么用得到。每一个Schema树的根节点为一个Struct类型,所有的column按照树的中序遍历顺序编号。

ORC只需要存储schema树中叶子节点的值,而中间的非叶子节点只是做一层代理,它们只需要负责孩子节点值得读取,只有真正的叶子节点才会读取数据,然后交由父节点封装成对应的数据结构返回。

文件结构


和Parquet类似,ORC文件也是以二进制方式存储的,所以是不可以直接读取,ORC文件也是自解析的,它包含许多的元数据,这些元数据都是同构ProtoBuffer进行序列化的。ORC的文件结构入图6,其中涉及到如下的概念:

  • ORC文件:保存在文件系统上的普通二进制文件,一个ORC文件中可以包含多个stripe,每一个stripe包含多条记录,这些记录按照列进行独立存储,对应到Parquet中的row group的概念。

  • 文件级元数据:包括文件的描述信息PostScript、文件meta信息(包括整个文件的统计信息)、所有stripe的信息和文件schema信息。

  • stripe:一组行形成一个stripe,每次读取文件是以行组为单位的,一般为HDFS的块大小,保存了每一列的索引和数据。

  • stripe元数据:保存stripe的位置、每一个列的在该stripe的统计信息以及所有的stream类型和位置。

  • row group:索引的最小单位,一个stripe中包含多个row group,默认为10000个值组成。

  • stream:一个stream表示文件中一段有效的数据,包括索引和数据两类。索引stream保存每一个row group的位置和统计信息,数据stream包括多种类型的数据,具体需要哪几种是由该列类型和编码方式决定。

ORC文件结构

图6 ORC文件结构

在ORC文件中保存了三个层级的统计信息,分别为文件级别、stripe级别和row group级别的,他们都可以用来根据Search ARGuments(谓词下推条件)判断是否可以跳过某些数据,在统计信息中都包含成员数和是否有null值,并且对于不同类型的数据设置一些特定的统计信息。

数据访问


读取ORC文件是从尾部开始的,第一次读取16KB的大小,尽可能的将Postscript和Footer数据都读入内存。文件的最后一个字节保存着PostScript的长度,它的长度不会超过256字节,PostScript中保存着整个文件的元数据信息,它包括文件的压缩格式、文件内部每一个压缩块的最大长度(每次分配内存的大小)、Footer长度,以及一些版本信息。在Postscript和Footer之间存储着整个文件的统计信息(上图中未画出),这部分的统计信息包括每一个stripe中每一列的信息,主要统计成员数、最大值、最小值、是否有空值等。

接下来读取文件的Footer信息,它包含了每一个stripe的长度和偏移量,该文件的schema信息(将schema树按照schema中的编号保存在数组中)、整个文件的统计信息以及每一个row group的行数。

处理stripe时首先从Footer中获取每一个stripe的其实位置和长度、每一个stripe的Footer数据(元数据,记录了index和data的的长度),整个striper被分为index和data两部分,stripe内部是按照row group进行分块的(每一个row group中多少条记录在文件的Footer中存储),row group内部按列存储。每一个row group由多个stream保存数据和索引信息。每一个stream的数据会根据该列的类型使用特定的压缩算法保存。在ORC中存在如下几种stream类型:

  • PRESENT:每一个成员值在这个stream中保持一位(bit)用于标示该值是否为NULL,通过它可以只记录部位NULL的值

  • DATA:该列的中属于当前stripe的成员值。

  • LENGTH:每一个成员的长度,这个是针对string类型的列才有的。

  • DICTIONARY_DATA:对string类型数据编码之后字典的内容。

  • SECONDARY:存储Decimal、timestamp类型的小数或者纳秒数等。

  • ROW_INDEX:保存stripe中每一个row group的统计信息和每一个row group起始位置信息。

在初始化阶段获取全部的元数据之后,可以通过includes数组指定需要读取的列编号,它是一个boolean数组,如果不指定则读取全部的列,还可以通过传递SearchArgument参数指定过滤条件,根据元数据首先读取每一个stripe中的index信息,然后根据index中统计信息以及SearchArgument参数确定需要读取的row group编号,再根据includes数据决定需要从这些row group中读取的列,通过这两层的过滤需要读取的数据只是整个stripe多个小段的区间,然后ORC会尽可能合并多个离散的区间尽可能的减少I/O次数。然后再根据index中保存的下一个row group的位置信息调至该stripe中第一个需要读取的row group中。

由于ORC中使用了更加精确的索引信息,使得在读取数据时可以指定从任意一行开始读取,更细粒度的统计信息使得读取ORC文件跳过整个row group,ORC默认会对任何一块数据和索引信息使用ZLIB压缩,因此ORC文件占用的存储空间也更小,这点在后面的测试对比中也有所印证。

在新版本的ORC中也加入了对Bloom Filter的支持,它可以进一步提升谓词下推的效率,在Hive 1.2.0版本以后也加入了对此的支持。

性能测试

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为了对比测试两种存储格式,我选择使用TPC-DS数据集并且对它进行改造以生成宽表、嵌套和多层嵌套的数据。使用最常用的Hive作为SQL引擎进行测试。

测试环境


  • Hadoop集群:物理测试集群,四台DataNode/NodeManager机器,每个机器32core+128GB,测试时使用整个集群的资源。

  • Hive:Hive 1.2.1版本,使用hiveserver2启动,本机MySql作为元数据库,jdbc方式提交查询SQL

  • 数据集:100GB TPC-DS数据集,选取其中的Store_Sales为事实表的模型作为测试数据

  • 查询SQL:选择TPC-DS中涉及到上述模型的10条SQL并对其进行改造。

测试场景和结果


整个测试设置了四种场景,每一种场景下对比测试数据占用的存储空间的大小和相同查询执行消耗的时间对比,除了场景一基于原始的TPC-DS数据集外,其余的数据都需要进行数据导入,同时对比这几个场景的数据导入时间。

场景一:一个事实表、多个维度表,复杂的join查询。

基于原始的TPC-DS数据集。

Store_Sales表记录数:287,997,024,表大小为:

  • 原始Text格式,未压缩 : 38.1 G

  • ORC格式,默认压缩(ZLIB),一共1800+个分区 : 11.5 G

  • Parquet格式,默认压缩(Snappy),一共1800+个分区 : 14.8 G

查询测试结果:

场景一结果

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