MRtrix3 构建白质纤维连接矩阵_从mrtrix中得到结构连接矩阵

作者：Monodyee | 2024-02-17 00:22:18

踩

从mrtrix中得到结构连接矩阵

tck2connectome: 这个命令可以利用streamlines文件和分割好的脑图(parcellation image)生成一个白质纤维连接矩阵。这里只介绍这个命令。

tck2connectome [ options ] tracks_in nodes_in connectome_out
1

如果不想一个个看，也可以直接参考例子。
（中文大部分机翻）

Options	Details	中文
-assignment_end_voxels	use a simple voxel lookup value at each streamline endpoint	在每个流线端点使用一个简单的体素查找值
-assignment_radial_search radius	perform a radial search from each streamline endpoint to locate the nearest node. Argument is the maximum radius in mm; if no node is found within this radius, the streamline endpoint is not assigned to any node. Default search distance is 4mm.	从每个流线端点进行径向搜索，找到最近的节点。参数是最大半径，单位是毫米；如果在这个半径内没有找到节点，流线端点就不会分配给任何节点。默认搜索距离为4mm。
-assignment_reverse_search max_dist	traverse from each streamline endpoint inwards along the streamline, in search of the last node traversed by the streamline. Argument is the maximum traversal length in mm (set to 0 to allow search to continue to the streamline midpoint).	从每个流线端点沿流线向内遍历，寻找流线最后穿越的节点。参数是最大遍历长度，单位是毫米（设置为0，允许继续搜索到流线中点）。
-assignment_forward_search max_dist	project the streamline forwards from the endpoint in search of a parcellation node voxel. Argument is the maximum traversal length in mm.	从端点开始向前投射流线，搜索一个取消节点体素。参数是最大遍历长度，单位是毫米。参数是最大遍历长度&#

声明：本文内容由网友自发贡献，不代表【wpsshop博客】立场，版权归原作者所有，本站不承担相应法律责任。如您发现有侵权的内容，请联系我们。转载请注明出处：https://www.wpsshop.cn/w/Monodyee/article/detail/98197