当前位置:   article > 正文

Python手册(Machine Learning)--XGBoost_python xgboost文档

python xgboost文档

title: Python(Machine Learning)–XGBoost
tags:

  • Python
  • 机器学习
    categories:
  • Python
  • Machine Learning
    cover: /img/XGBoost-cover.svg
    top_img: /img/XGBoost-cover.svg
    abbrlink: c46d5dae
    date: 2024-01-25 22:15:00
    description:

Quick Start

XGBoost本质上还是一个GBDT,但是力争把速度和效率发挥到极致,所以叫 Extreme Gradient Boosting。XGBoost高效地实现了GBDT算法,并进行了算法和工程上的许多改进,被广泛应用在Kaggle竞赛及其他许多机器学习竞赛中,并取得了不错的成绩。

而在实际建模环节,XGBoost提供了Sklearn API和原生API两套调用方法。大部分时候我们使用原生代码来运行xgboost,因为这套原生代码是完全为集成学习所设计的,不仅可以无缝使用交叉验证、默认输出指标为RMSE,还能够默认输出训练集上的结果帮我们监控模型。

  1. 首先,原生代码必须使用XGBoost自定义的数据结构DMatrix,这一数据结构能够保证xgboost算法运行更快,并且能够自然迁移到GPU上运行。
  2. 当设置好数据结构后,我们需要以字典形式设置参数。XGBoost也可以接受像sklearn一样,将所有参数都写在训练所用的类当中,然而由于xgboost的参数列表过长、参数类型过多,直接将所有参数混写在训练模型的类中会显得代码冗长且混乱,因此我们往往会使用字典单独呈现参数。
  3. 准备好参数列表后,我们将使用xgboost中自带的方法xgb.trainxgb.cv进行训练,训练完毕后,我们可以使用predict方法对结果进行预测。虽然xgboost原生代码库所使用的数据结构是DMatrix,但在预测试输出的数据结构却是普通的数组,因此可以直接使用sklearn中的评估指标,或者python编写的评估指标进行评估。
数据结构说明
xgboost.DMatrixXGBoost数据集
xgboost.DataIter迭代数据
xgboost.QuantileDMatrix直接为hist方法生成分位数数据
xgboost.BoosterXGBoost中的返回的模型
xgboost.DMatrix(data, 
                label=None, 
                weight=None, 
                base_margin=None, 
                missing=None, 
                silent=False, 
                feature_names=None, 
                feature_types=None, 
                nthread=None, 
                group=None, 
                qid=None, 
                label_lower_bound=None, 
                label_upper_bound=None, 
                feature_weights=None, 
                enable_categorical=False, 
                data_split_mode=DataSplitMode.ROW)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16

常用参数:

  • data 内部数据集的数据源
  • label 数据标签
  • weight 每个样本的权重
  • feature_names 特征名称
  • feature_types 数据类型。如果设置 enable_categorical=False,字符“c”代表分类数据,字符 "q"代表数值型数据。
  • feature_weights - Set feature weights for column sampling.
  • enable_categorical 允许分类特征

现在,我们来简单看看原生代码是如何实现的。

Step 1: Load the dataset

DMatrix会将特征矩阵与标签打包在同一个对象中,且一次只能转换一组数据。并且,我们无法通过索引或循环查看内部的内容,一旦数据被转换为DMatrix,就难以调用或修改了。

因此,数据预处理需要在转换为DMatrix之前做好。如果我们有划分训练集和测试集,则需要分别将训练集和测试集转换为DMatrix。

# load or create your dataset
import xgboost as xgb
from sklearn.datasets import load_boston
from sklearn.model_selection import train_test_split

X, y = load_boston(return_X_y=True)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=0.3)

# create DMatrix for xgboost
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
dtest = xgb.DMatrix(X_test, y_test)

# specify validations set to watch performance
watchlist = [(dtest, "eval"), (dtrain, "train")]
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14

对于表示分类要素的所有列。之后,用户可以告诉 XGBoost 启用使用分类数据进行训练。假设您正在使用 for 分类问题,请指定 参数:enable_categorical

XGBoost 可以直接支持分类特征,而不需要 one-hot 编码。传递分类数据最简单方法是使用 dataframe ,将数据类型指定为 category。

# We need to specify the data type of input  as category.
X["cat_feature"].astype("category")
  • 1
  • 2

之后通过指定参数 enable_categorical=True 来启用分类数据进行训练

# Specify `enable_categorical` to True
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train, enable_categorical=True)

booster = xgb.train({"tree_method": "hist", "max_cat_to_onehot": 5}, Xy)
# Must use JSON for serialization, otherwise the information is lost
booster.save_model("categorical-model.json")
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6

Note: 在构建 DMatrix 前,先把分类特征转换成整数型。

对于其他类型的输入,例如 numpy/cupy array,我们可以通过 feature_types 参数设置分类特征。“q” 或 “float” 代表数值型特征,“c”代表分类特征。

#  "q" is numerical feature, while "c" is categorical feature
ft = ["q", "c", "c"]
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train, feature_types=ft, enable_categorical=True)
  • 1
  • 2
  • 3

Step 2: Setting Parameters

# specify parameters via map
param = {'booster': 'dart',
         'max_depth': 5, 
         'learning_rate': 0.1,
         'objective': 'binary:logistic',
         'sample_type': 'uniform',
         'normalize_type': 'tree',
         'rate_drop': 0.1,
         'skip_drop': 0.5}

# You can also specify multiple eval metrics:
params['eval_metric'] =  ['error', 'rmse']
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12

Step 3: Training

# Training a model requires a parameter list and data set:
evals_result = {}
bst = xgb.train(params,
                dtrain,
                num_boost_round=20,
                evals=watchlist,
                evals_result = evals_result,
                early_stopping_rounds=10)

# Training with 5-fold CV:
xgb.cv(params, dtrain, num_boost_round=20, nfold=5)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11

不难发现,XGBoost不需要实例化,xgb.train函数包揽了实例化和训练的功能,一行代码解决所有问题。

Step 4: Save and load model

# Save model
bst.save_model("model.json")
# load model
bst = xgb.Booster(model_file="model.json")

# alternatively, you can pickle the booster
import pickle
with open('model.pkl', 'wb') as fout:
    pickle.dump(bst, fout)
with open('model.pkl', 'rb') as fin:
    bst = pickle.load(fin)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11

XGBoost在Booster对象中有一个名为dump_model的函数,它允许以textjsondot(graphviz)等可读格式导出模型。它的主要用于模型解释或可视化,不应该重新加载回XGBoost。

# dump model
bst.dump_model("dump.raw.txt")
# dump model with feature map
bst.dump_model("dump.nice.txt", os.path.join(DEMO_DIR, "data/featmap.txt"))
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4

Step 5: Predict

# run prediction
y_pred = bst.predict(dtest)
y_true = dtest.get_label()

# If early stopping is enabled during training, you can get predictions from the best iteration with bst.best_iteration:
y_pred = bst.predict(dtest, iteration_range=(0, bst.best_iteration + 1))
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6

Step 6: Evaluating

from sklearn.metric import mean_squared_error
rmse_test = mean_squared_error(y_true, y_pred) ** 0.5
print(f'The RMSE of prediction is: {rmse_test}')
  • 1
  • 2
  • 3

参数

xgboost将参数分为了两大部分,一部分可以通过params进行设置,另一部分则需要在方法xgb.train或者xgb.cv中进行设置。遗憾的是,xgboost并没有明确对参数分割的条件和理由,但一般来说,除了迭代次数和提前停止这两个关键元素,其他参数基本都被设置在params当中。如果在实际运行过程中,出现了警告或报错,则根据实际情况进行调整。

一般参数

  • booster:指定算法类型。default= gbtree 可以是gbtree、gblinear或dart。gbtree和dart使用基于树的模型,而gblinear使用线性函数。
  • device:学习设备。default = cpu
  • nthread:如果未设置,默认为最大可用线程数。
  • seed:随机种子。
  • verbosity:打印消息的详细性。有效值为0(静音)、1(警告)、2(信息)和3(调试),default=1。可以使用 xgboost.config_context() 在全局范围内设置。
  • num_parallel_tree 每次迭代期间构建的并行树的数量。此选项用于支持增强的随机森林。default=1
  • multi_strategy 用于训练多目标模型的策略,包括多目标回归和多类分类。default= one_output_per_tree
    • one_output_per_tree:每个目标一个模型。
    • multi_output_tree:使用多目标树。

样本处理参数

  • scale_pos_weight 控制正负样本的权重平衡,典型值:sum(negative instances)/sum(positive instances) 。default=1

特征处理参数

  • max_cat_to_onehot 决定XGBoost是否使用one-hot编码的阈值。当类别数量小于阈值时,则选择one-hot编码,否则类别将被划分为子节点。
  • max_cat_threshold 每一次分裂的最大类别数
  • max_bin 最大分箱数。仅当tree_method设置为histapprox时使用。default=256
    Monotonic Constraints 单调约束
    Feature Interaction Constraints 特征交互约束

决策树生成

  • tree_method XGBoost中使用的树构造算法。default=auto
    • auto:与hist树方法相同。
    • exact:精确的贪婪算法。列举所有拆分候选。
    • approx:使用分位数草图和梯度直方图的近似贪婪算法。
    • hist:直方图算法。
    • 对于refresh等其他更新程序,请直接设置参数updater
  • max_depth 一棵树的最大深度。default=6
  • max_leaves 要添加的最大节点数。default=0
  • min_child_weight 每个节点所需的最小实例数量。default=1
  • grow_policy 控制将新节点添加到树中的方式,目前仅在tree_method设置为histapprox时支持。。default=depthwise
    • depthwise:在最靠近根的节点上拆分。
    • lossguide:在损失变化最大的节点上拆分。

迭代过程

  • eta 学习率,范围 [0,1]。default=0.3,别名 learning_rate
  • lambda L2正则化系数。default=1,别名 reg_lambda
  • alpha L1正则化系数。default=0,别名:reg_alpha
  • gamma 依照叶子总量对目标函数施加惩罚的系数。default=0,别名:min_split_loss

目标函数
O b j k = ∑ i l ( y i , y i ^ ) + γ T + 1 2 λ ∑ j = 1 T w j 2 + α ∑ j = 1 T w j Obj_k = \sum_{i}l(y_i,\hat{y_i}) + \gamma T + \frac{1}{2}\lambda\sum_{j=1}^Tw_j^2 + \alpha\sum_{j=1}^Tw_j Objk=il(yi,yi^)+γT+21λj=1Twj2+αj=1Twj
其中 T T T表示当前第 k k k棵树上的叶子总量, w j w_j wj则代表当前树上第 j j j片叶子的叶子权重(leaf weights),即当前叶子 j j j的预测值。正则项有两个:使用平方的 ℓ 2 \ell_2 2正则项与使用绝对值的 ℓ 1 \ell_1 1正则项。

  • subsample 训练集的采样比率。子采样将在每次提升迭代中发生一次。default=1
  • sampling_method 训练集的子采样方法。default=uniform
    • uniform:每个训练实例被选中的概率相等。通常设置subsample>= 0.5以获得良好的结果。
    • gradient_based:每个训练实例的选择概率与梯度的正则化绝对值成正比。更具体地说,subsample可以设置为低至0.1,而不会损失模型准确性。请注意,仅当tree_method设置为hist且设备为cuda才支持此采样方法;其他树方法仅支持uniform采样。
  • colsample_bytree, colsample_bylevel, colsample_bynode 这是用于特征子采样的参数系列。default=1
    • colsample_bytree是构建每棵树时列的子采样比率。每构建一棵树,子采样都会发生一次。
    • colsample_bylevel是每个级别的列的子采样比率。每在树上达到一个新的深度水平,就会进行子采样。是从当前树的列集进行子采样的。
    • colsample_bynode是每个节点(拆分)的列子采样比率。每次评估新的拆分时,子采样都会发生一次。是从当前级别的列集进行子采样的。
    • colsample_by*参数累积工作。例如,具有64个特征的组合{'colsample_bytree':0.5,'colsample_bylevel':0.5,'colsample_bynode':0.5}将在每次拆分时留下8个特征可供选择。
    • 构建数据集时,可以为DMatrix设置feature_weights,以定义使用列采样时选择每个特征的概率。sklearn界面中的fit方法有一个类似的参数。
  • updater 提供了构建和修改树的模块化方式。这是一个高级参数,通常会自动设置。
    • grow_colmaker:非分布式柱式树结构。
    • grow_histmaker:基于直方图计数的全局提案,基于行的数据拆分的分布式树结构。
    • grow_quantile_histmaker:使用量化直方图构建树。
    • grow_gpu_hist:当tree_methoddevice=cuda一起设置为hist启用。
    • grow_gpu_approx:当tree_methoddevice=cuda一起设置为approx启用。
    • sync:同步所有分布式节点中的树。
    • refresh:根据当前数据刷新树的叶节点权重和/或叶节点值。请注意,不会对数据行进行随机子采样。
    • prune:修剪损失小于 min_split_loss(或gamma)和深度大于max_depth的节点。
  • refresh_leaf 这是refresh更新程序的一个参数。当设置为1时,叶节点值和权重都会更新。当设置为0时,只更新叶节点权重。default=1
  • process_type 指定提升过程。default=default
    • default:创造新树的正常提升过程。
    • update:从现有模型开始,仅更新现有的树。在每次提升迭代中,从初始模型中获取一棵树,为该树运行指定的更新程序,并将修改后的树添加到新模型中。新模型将具有相同或更少的树,这取决于执行的增强迭代次数。目前,仅 updater 设置为 refreshprune时有意义。使用process_type=update时,不能使用创建新树的更新程序。
  • max_delta_step 一次迭代中所允许的最大迭代值。通常不需要这个参数,但当类极度不平衡时,它可能有助于逻辑回归。将其设置为1-10的值可能有助于控制更新。default=0

树方法:对于训练 boosted tree 模型,有2个参数用于选择算法,即updater和tree_method。XGBoost有3种内置树方法,即exact、approx和hist。除了这些树方法外,还有一些独立的更新程序,包括refresh、prune和sync。参数updater比tree_method更原始,因为后者只是前者的预配置,差异主要是由于历史原因。

模型训练

  • objective 选择需要优化的损失函数。default=reg:squarederror
    • 回归问题: reg:squarederrorreg:squaredlogerrorreg:pseudohubererrorreg:absoluteerrorreg:quantileerrorpinballlosscount:poissonreg:gammareg:tweedie
    • 分类问题: reg:logisticbinary:logisticbinary:logitrawbinary:hingemulti:softprobmulti:softmax
    • 生存分析:survival:coxsurvival:aft
    • 排序问题:rank:ndcgrank:maprank:pairwise
  • base_score 初始化预测结果 H 0 H_0 H0的设置
  • eval_metric 评估指标。将根据 objective分配默认值:回归的rmse,分类的logloss,rank:map的平均精度等。支持添加多个评估指标。
    • 回归问题: rmsermslemaemapemphe
    • 分类问题:loglosserrorerror@t 可以通过 t 来指定与0.5不同的二分类阈值、 merrormloglossaucaucprmap
  • disable_default_eval_metric:是否禁用默认评估函数。default= False
modulecomment
xgboost.train指定参数训练
xgboost.cv交叉验证训练

主要参数:

  • params - Booster 参数字典
  • dtrain 用于训练的数据集
  • num_boost_round 提升迭代次数,即生成的基学习器的数量
  • evals 验证/测试数据
  • obj 自定义目标函数
  • feval 自定义评估函数(已废弃)
  • maximize 是否最大化 feval
  • early_stopping_rounds 提前停止,需要至少一个evals。如果evals、eval_metric不止一个,则选用最后一个判断提前停止
  • evals_result 记录验证集的评估结果
  • verbose_eval
  • xgb_model 初始化模型,允许继续训练
  • callbacks 回调函数列表
  • custom_metric 自定义评估函数
  • nfold CV值
  • stratified 是否分层抽样
  • folds sklearn - a KFold or StratifiedKFold instance or list of fold indices
  • as_pandas 是否转化为pandas
  • show_stdv 是否打印标准差

回调参数

方法Create a callback
xgboost.callback.TrainingCallbackInterface for training callback.
xgboost.callback.EvaluationMonitor(rank=0, period=1, show_stdv=False)输出评估结果的频率
xgboost.callback.EarlyStopping(rounds)回调提前停止策略,控制过拟合风险,当验证集上的精度若干轮不下降,提前停止训练。
xgboost.callback.LearningRateScheduler(learning_rates)调度学习率
D_train = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
D_valid = xgb.DMatrix(X_valid, y_valid)

# Define a custom evaluation metric used for early stopping.
def eval_error_metric(predt, dtrain: xgb.DMatrix):
    label = dtrain.get_label()
    r = np.zeros(predt.shape)
    gt = predt > 0.5
    r[gt] = 1 - label[gt]
    le = predt <= 0.5
    r[le] = label[le]
    return 'CustomErr', np.sum(r)

# Specify which dataset and which metric should be used for early stopping.
early_stop = xgb.callback.EarlyStopping(rounds=early_stopping_rounds,
                                        metric_name='CustomErr',
                                        data_name='Train')

booster = xgb.train(
    params = {'objective': 'binary:logistic',
              'eval_metric': ['error', 'rmse'],
              'tree_method': 'hist'}, 
    dtrain = D_train,
    evals=[(D_train, 'Train'), (D_valid, 'Valid')],
    feval=eval_error_metric,
    num_boost_round=1000,
    callbacks=[early_stop],
    verbose_eval=False)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28

自定义损失函数

xgboost 在 xgb.train中通过参数obj和custom_metric来自定损失函数和评估函数。

自定义损失函数接受predt和dtrain作为输入,返回损失函数的一阶(grad)和二阶(hess)导数。

import xgboost as xgb
from typing import Tuple

def gradient(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> np.ndarray:
    '''Compute the gradient squared log error.'''
    y = dtrain.get_label()
    return (np.log1p(predt) - np.log1p(y)) / (predt + 1)

def hessian(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> np.ndarray:
    '''Compute the hessian for squared log error.'''
    y = dtrain.get_label()
    return ((-np.log1p(predt) + np.log1p(y) + 1) /
            np.power(predt + 1, 2))

def squared_log(predt: np.ndarray,
                dtrain: xgb.DMatrix) -> Tuple[np.ndarray, np.ndarray]:
    '''Squared Log Error objective. A simplified version for RMSLE used as
    objective function.
    
    :math:`\frac{1}{2}[log(pred + 1) - log(label + 1)]^2`
    '''
    predt[predt < -1] = -1 + 1e-6
    grad = gradient(predt, dtrain)
    hess = hessian(predt, dtrain)
    return grad, hess
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25

自定义损失函数后,模型的输出不在是 [0,1] 概率输出,而是 sigmoid 函数之前的输入值。因此,需要写出对应的评估函数。

def rmsle(predt: np.ndarray, dtrain: xgb.DMatrix) -> Tuple[str, float]:
    ''' Root mean squared log error metric.'''
    y = dtrain.get_label()
    predt[predt < -1] = -1 + 1e-6
    elements = np.power(np.log1p(y) - np.log1p(predt), 2)
    return 'PyRMSLE', float(np.sqrt(np.sum(elements) / len(y)))
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6

评估函数也接受predt和dtrain作为输入,返回本身的名称和浮点值作为结果。

xgb.train({'tree_method': 'hist', 'seed': 1994,
           'disable_default_eval_metric': 1},
          dtrain=dtrain,
          num_boost_round=10,
          obj=squared_log,
          custom_metric=rmsle,
          evals=[(dtrain, 'dtrain'), (dtest, 'dtest')],
          evals_result=results)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8

请注意,参数disable_default_eval_metric用于抑制XGBoost中的默认度量。

当自定义损失函数后,模型 predict 将会输出原始值,需要手动进行sigmoid函数变换。可以通过predict函数中的output_margin参数来控制

Scikit-Learn API

XGBoost的原生代码与我们已经习惯了的sklearn代码有很大的不同。对于熟悉sklearn的我们来说,许多人也会倾向于使用xgboost自带的sklearn接口来实现算法。通过这个接口,我们可以使用跟sklearn代码一样的方式来实现xgboost,即可以通过fit和predict等接口来执行训练预测过程,也可以调用属性比如coef_等。

在XGBoost的sklearn API中,我们可以看到下面五个类:

modulecomment
XGBRegressor实现xgboost回归
XGBClassifier实现xgboost分类
XGBRanker实现xgboost排序
XGBRFClassifier基于xgboost库实现随机森林分类
XGBRFRegressor基于xgboost库实现随机森林回归

其中XGBRF的两个类是以XGBoost方式建树、但以bagging方式构建森林的类,通常只有在我们使用普通随机森林效果不佳、但又不希望使用Boosting的时候使用。这种使用XGBoost方式建树的森林在sklearn中已经开始了实验,不过还没有正式上线。

另外两个类就很容易理解了,一个是XGBoost的回归,一个是XGBoost的分类。这两个类的参数高度相似,我们可以以XGBoost分类为例查看:

XGBClassifier(
    n_estimators : int = None,
    max_depth : int = None,
    max_leaves : int = None,
    max_bin : int = None,
    grow_policy : {0, 1} = None,
    learning_rate : float = None,
    objective: Union[str, Callable, NoneType] = "binary:logistic",
    booster : str = None, # gbtree, gblinear or dart.
    tree_method : str = None,
    n_jobs : int = None,
    gamma : float = None,
    min_child_weight : float = None,
    max_delta_step : float = None,
    subsample : float = None,
    sampling_method : {"uniform", "gradient_based"} = None,
    colsample_bytree : float = None,
    colsample_bylevel : float = None,
    colsample_bynode : float = None,
    reg_alpha : float = None,
    reg_lambda : float = None,
    scale_pos_weight : float = None,
    base_score : NoneType = None,
    missing : float = np.nan,
    num_parallel_tree : int = None,
    monotone_constraints : Union[Dict[str, int], str]] = None,
    interaction_constraints : Union[str, List[Tuple[str]]] = None, 
    importance_type : str = None,
    device : {"cpu", "cuda", "gpu"} = None,
    validate_parameters : bool = None,
    enable_categorical : bool = False,
    feature_types : FeatureTypes = None,
    max_cat_to_onehot : int = None,
    max_cat_threshold : int = None,
    multi_strategy : {"one_output_per_tree", "multi_output_tree"} = None,
    eval_metric : Union[str, List[str], Callable] = None,
    early_stopping_rounds : int = None,
    callbacks : List[TrainingCallback] = None,
    random_state : Union[numpy.random.RandomState, int] = None,
    verbosity : int = None,
    **kwargs : dict = None
)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
  • 32
  • 33
  • 34
  • 35
  • 36
  • 37
  • 38
  • 39
  • 40
  • 41
  • 42

具体的模型训练过程和sklearn中其他模型一样,通过fit进行训练,并利用predict进行结果输出:

from xgboost import XGBClassifier
from sklearn.datasets import load_iris
from sklearn.model_selection import train_test_split

# read data
X, y = load_iris(return_X_y=True)
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=.2)
# create model instance
clf = XGBClassifier(n_estimators=2, max_depth=2, learning_rate=1, objective='binary:logistic')
# fit model
clf.fit(X_train, y_train)
# make predictions
preds = clf.predict(X_test)
# Save model into JSON format.
clf.save_model("clf.json")
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15

可视化

modulecomment
plot_importance(booster)绘制模型的特征重要性。
plot_tree(booster)绘制指定的树
to_graphviz(booster)创建指定树的二叉图文件

继续训练

XGBoost提供两种增量学习的方式:

  • 一种是在当前迭代树的基础上增加新树,原树不变;
  • 一种是当前迭代树结构不变,重新计算叶节点权重和/或叶节点值。

在初始化模型 xgb_model 上继续训练

# Train 128 iterations, with the first one runs for 32 iterations and
# the second one runs for 96 iterations
clf1 = xgboost.XGBClassifier(n_estimators=32)
clf1.fit(X, y, eval_set=[(X, y)], eval_metric="logloss")
assert clf1.get_booster().num_boosted_rounds() == 32

clf2 = xgboost.XGBClassifier(n_estimators=128 - 32)
clf2.fit(X, y, eval_set=[(X, y)], eval_metric="logloss", xgb_model=clf1)

print("Total boosted rounds:", clf.get_booster().num_boosted_rounds())
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10

使用process_type参数更新叶节点

# using `process_type` with `prune` and `refresh`
n_rounds=32

# Train a model first
Xy = xgb.DMatrix(X_train, y_train)
evals_result = {}
booster = xgb.train(
    {"tree_method": "hist", "max_depth": 6, "device": "cuda"},
    Xy,
    num_boost_round=n_rounds,
    evals=[(Xy, "Train")],
    evals_result=evals_result,
)

# Refresh the leaf value and tree statistic
Xy_refresh = xgb.DMatrix(X_refresh, y_refresh)
# The model will adapt to new data by changing leaf value (no change in
# split condition) with refresh_leaf set to True.
refresh_result = {}
refreshed = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "refresh", "refresh_leaf": True},
    Xy_refresh,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_refresh, "Train")],
    evals_result=refresh_result,
)

# Refresh the model without changing the leaf value, but tree statistic including
# cover and weight are refreshed.
refresh_result = {}
refreshed = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "refresh", "refresh_leaf": False},
    Xy_refresh,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_refresh, "Train")],
    evals_result=refresh_result,
)

# Prune the trees with smaller max_depth
Xy_update = xgb.DMatrix(X_update, y_update)
prune_result = {}
pruned = xgb.train(
    {"process_type": "update", "updater": "prune", "max_depth": 2},
    Xy_update,
    num_boost_round=n_rounds,
    xgb_model=booster,
    evals=[(Xy, "Original"), (Xy_update, "Train")],
    evals_result=prune_result,
)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
  • 26
  • 27
  • 28
  • 29
  • 30
  • 31
  • 32
  • 33
  • 34
  • 35
  • 36
  • 37
  • 38
  • 39
  • 40
  • 41
  • 42
  • 43
  • 44
  • 45
  • 46
  • 47
  • 48
  • 49
  • 50
  • 51

分布式学习

XGBoost with PySpark

从1.7.0版本开始,xgboost已经封装了pyspark API,因此不需要纠结spark版本对应的jar包 xgboost4j 和 xgboost4j-spark 的下载问题了,也不需要下载调度包 sparkxgb.zip。

算法说明
xgboost.spark.SparkXGBClassifierPySpark分类算法
xgboost.spark.SparkXGBRegressorPySpark回归算法
xgboost.spark.SparkXGBRankerPySpark排名算法

以 SparkXGBClassifier 为例,介绍下XGBoost在spark中的用法

xgboost.spark.SparkXGBClassifier(
    features_col='features', 
    label_col='label', 
    prediction_col='prediction', 
    probability_col='probability', 
    raw_prediction_col='rawPrediction', 
    pred_contrib_col=None, 
    validation_indicator_col=None, 
    weight_col=None, 
    base_margin_col=None, 
    num_workers=1, 
    use_gpu=None, 
    device=None, 
    force_repartition=False, 
    repartition_random_shuffle=False, 
    enable_sparse_data_optim=False, 
    **kwargs)
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
from xgboost.spark import SparkXGBClassifier
from pyspark.ml.linalg import Vectors

spark = SparkSession.builder.master("local[*]").getOrCreate()

# create dataset
df_train = spark.createDataFrame([
    (Vectors.dense(1.0, 2.0, 3.0), 0, False, 1.0),
    (Vectors.sparse(3, {1: 1.0, 2: 5.5}), 1, False, 2.0),
    (Vectors.dense(4.0, 5.0, 6.0), 0, True, 1.0),
    (Vectors.sparse(3, {1: 6.0, 2: 7.5}), 1, True, 2.0),
], ["features", "label", "isVal", "weight"])
df_test = spark.createDataFrame([
    (Vectors.dense(1.0, 2.0, 3.0), ),
], ["features"])

# train xgboost classifier model
clf = SparkXGBClassifier(max_depth=5, missing=0.0,
    validation_indicator_col='isVal', weight_col='weight',
    early_stopping_rounds=1, eval_metric='logloss')
model = xgb_classifier.fit(df_train)
predict_df = model.transform(df_test)

classifier_evaluator = MulticlassClassificationEvaluator(metricName="f1")
print(f"classifier f1={classifier_evaluator.evaluate(predict_df)}")
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 7
  • 8
  • 9
  • 10
  • 11
  • 12
  • 13
  • 14
  • 15
  • 16
  • 17
  • 18
  • 19
  • 20
  • 21
  • 22
  • 23
  • 24
  • 25
声明:本文内容由网友自发贡献,不代表【wpsshop博客】立场,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有侵权的内容,请联系我们。转载请注明出处:https://www.wpsshop.cn/w/人工智能uu/article/detail/949336
推荐阅读
相关标签
  

闽ICP备14008679号