VCF比对工具的安装及使用

作者：你好赵伟 | 2024-06-19 12:58:47

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如何安装vcf比较软件 hap.py

过程参考https://vcftools.github.io/examples.html


git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git
cd vcftools
./autogen.sh
./configure
make
make install

遇到的问题包括：

（1）./autogen.sh时报autoreconf: not found 安装apt-get install autoconf

（2）缺少zlib sudo apt-get install zlib1g-dev

显示版本信息：

vcftools

比对两个vcf文件

vcftools --vcf input_data.vcf --diff other_data.vcf --out compare

tips：sudo apt install vcftools

转载于:https://my.oschina.net/u/3732258/blog/1933150

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