肺癌相关文献7

第十五篇

A qualitative transcriptional signature for the histological reclassification of lung squamous cell carcinomas and adenocarcinomas
IF:4.4 中科院分区:2区 生物学WOS 分区:Q1

背景

非小细胞肺癌（NSCLC）约占肺癌的80%[1]，有两种主要的组织学亚型：腺癌（ADC）和鳞状细胞癌（SCC）[2]，两种类型对药物的响应程度不一致。因此，非小细胞肺癌的靶向治疗取决于组织学。从苏木精-伊红 （HE） 染色中观察到的微观形态学特征是目前肺癌组织学分类的“黄金”标准。一般而言，如果有足够的肿瘤标本，且肿瘤分化良好或中度，影像学检查技术足以确定ADC或鳞状细胞癌[1]。然而，低分化标本或小活检标本（约占肺癌初始诊断的70%）的组织学分类仍然是一个挑战。基于SCC和ADC免疫标志物（如TTF-1和p63）的组合[11]，仍有约10%的样本无法分类，因为它们对两种免疫标志物均呈阳性或阴性[15]。开发一个非TTF-1和p63的标志物，能实现更好的分类，对无法分类的病人进行更精准的治疗。

结果

1.识别用于区分ADC和SCC的特征

找到一对标志对，基因对KRT5和AGR2作为区分ADC和SCC的标志。标志的分类规则是，如果KRT5的mRNA表达水平高于AGR2，则将样本归类为SCC;否则是ADC。
== 没有详细讲筛选过程，这篇文章的重点不在筛选，而是验证与说明==

2.pADC 和 pSCC 中的 Krt5 和 Agr2 蛋白免疫染色

在96个pADC样品中，Agr2蛋白在63个（65.63%）样品中高表达，而Krt5蛋白仅在7个（7.29%）样品中高表达。相反，在80个pSCC样品中，Krt5蛋白在43个（53.75%）样品中高表达，而Agr2蛋白仅在8个（10.00%）样品中高表达（图10.00%）。​结果表明，Krt5蛋白主要在pSCC样品中表达，而Agr2蛋白主要在pADC样品中表达。该结果为区分ADC和SCC的特征提供了生物学证据。然而，IHC分析还显示，6份（6.25%）pADC样品和2份（2.50%）pSCC的Krt5和Agr2蛋白均高表达，12份（12.50%）pADC和13份（16.25%）pSCC样品的Krt5和Agr2蛋白均低表达，提示免疫标志物IHC在鉴别ADC和SCC方面的局限性。
免疫组化为金标准，该结果一方面可以说明作者标志的吻合程度，一方面可以说明利用免疫组化存在的局限性

3.标志验证

其他验证集验证，验证集很多。重点在于作者将分成ADC类的SCC与ADC类比较生存，分成SCC类的ADC与SCC类比较生存，借以说明原先判定标准可能确为失误。再看重分类样本的增殖得分，说明预后更差。

为验证，通过重分类与原先分类的生存、增殖、标志基因、样本类型（FFPE、正常取样）等来说明重分类存在的正确性可能

讨论

1.文章数据根据WHO 2004 标准诊断，非最新版，但该问题存在于普遍数据库中。
2.REO方法只能做二分类。