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基于3d slicer开发医学图像标注插件

基于3d slicer开发医学图像标注插件

基于3d slicer开发医学图像标注插件

3d slicer是一款开源的医学图像处理软件,它基本上集成了医学图像处理的所有功能,包括重建、分割、配置、分析、实时导航等功能。3d slicer是基于ITK、VTK、DCMTK、CTK、QT等开发的,以插件的方式实现医学图像的处理分析功能,提供了C++、Paython、CLI的程序开发接口。我们通过编译源码,采用C++实现了一个医学图像标注插件。该标注插件实现了DICOM信息的导出、PACAS诊断信息的录入、标注信息的录入、自动生成XML格式的标注文件以及标注文件的解析。它主要应用于乳腺图像和肺结节图像的标注,为医学图像数据集的收集提供更加简单、快捷的标注工具,自动生成标签文件。立方体感兴趣区域标示出病灶的边界,得到病灶的中心位置和半径,适用于二维和三维图像的标注,这样的标注模式更加适用于深度学习算法数据集的标注。标注信息文件采用XML格式,使得在不同平台上的数据交换和共享成为可能。


该插件各个模块的功能如下:
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