GWAS数据库ieugwasr包最新配置API用户Token方法_rstudio如何设置token

作者：神奇cpp | 2024-08-10 20:16:35

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rstudio如何设置token

Perform fast queries against a massive database of complete GWAS summary data • ieugwasr (mrcieu.github.io)https://mrcieu.github.io/ieugwasr/articles/guide.html以上是获取的网址。

注册后可以获得TOKEN-用的github账户。

设置 R（ieugwasr 包）
1.1 创建.Renviron文件（直接在Rstudio中目录建立一个叫“.Renviron”的文本文件）
1.2 修改.Renviron文件内容
内容是：OPENGWAS_JWT=你的TOKEN

2.2 重启 R session
记得一定要重启 R session-Ctrl+Shift+F10

3.3 运行测试

install.packages("ieugwasr")
# 载入包
library(dplyr) #这个包提供管道符号支持
library(ieugwasr)
# 查看是否识别到token
ieugwasr::get_opengwas_jwt()
# user()，查看token对应的用户信息
ieugwasr::user()
# api_status()
ieugwasr::api_status()

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