Li‘s 核磁共振影像数据处理-24-Diffusion Tookit纤维追踪、FA、ADC参数图计算以及TrackVis纤维可视化_diffusion toolkit

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注意Diffusion Toolkit仅可以进行确定性纤维追踪
官网下载地址： http://www.trackvis.org/
需填写邮箱、单位等基本信息后下载。
打开软件后“Image model”选择“DTI”。
勾选“Reconstruction”进行重建。
“Raw data files”选择影像路径。官方称支持dicom格式，但笔者实际使用中无法选择多张dicom影像。不知道哪里出了问题。
“Maximum b value”根据实际情况填写。

“Gradient table”需根据影像填写，并且注意格式，其与dicom转化nifti格式过程中生成的bvec文件有所区别。

勾选“Tracking”进行确定性纤维追踪。不勾选这只进行重建，计算FA、ADC等参数图。
“Tracking”下选择一般保持自动生成即可。特殊情况可自行设置。
如勾选“Launch TrackVis automatically”，在纤维追踪后将自动打开可视化软件TrackVis。
点击“Preview Script”可查看脚本。该脚本可复制粘贴到命令提示符（Windows）或终端（Linux和macOS）中执行，或进行脚本改写。
点击“Run”则开始运行。运行结束会生成ADC、FA等参数图，dwi影像以及纤维追踪结果等。

具体文件对应关系可参考官网介绍 http://www.trackvis.org/dtk/?subsect=format
TrackVis中可通过“File”菜单下“Load image …”选项加载影像。

“Property”选项下有多种可视化选项进行调整。