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集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用_集成多组学数据的机器学习 代谢 宏基因组 联合分析

集成多组学数据的机器学习 代谢 宏基因组 联合分析

机器学习基本概念进行介绍,让大家对机器学习基本概念有大致了解。明确机器学习方法的适用性,优势,以及局限性等

Ø 什么是机器学习

Ø 机器学习的应用实例

Ø 生物组学简介(基因组学,转录组学,蛋白组学,代谢组学)

Ø 机器学习在在多组学数据分析的应用

:机器学习主流实现是python语言。学习机器学习之前,有针对性的对python进行系统的学习,数据的基本处理,以方便将来开展机器学习的学习

Ø python安装与开发环境的搭建

Ø 基本数据类型、组合数据类型

Ø 函数、列表 、元组、字典、集合

Ø 控制结构、循环结构

Ø Numpy模块——矩阵的科学计算

Ø Matplotlib模块——数据处理与绘图

Ø Pandas模块——csv数据处理与分析

Ø Sklearn模块——机器学习模型基础软件包调用

² :利用Python pandas读取组学CSV数据并进行数据探索可视化分析(Exploratory data analysis,EDA)

:对在多组学整合分析中最常使用的几种机器学习模型进行介绍,总结它们的优缺点及适用范围,通过动手实践快速掌握几种方法

Ø 线性模型(线性回归、梯度下降、正则化、回归的评价指标)

Ø 决策树(决策树原理、ID3算法、C4.5算法、CART算法)

Ø 支持向量机(线性支持向量机、可分支持向量机、不可分支持向量机

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