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matlab中mk突变检验代码

matlabmk突变检验代码

Matlab 中的 MK 突变检验代码可以使用现有的工具箱或第三方工具箱进行实现。

一种可行的方法是使用 Bioinformatics Toolbox。Bioinformatics Toolbox 提供了 seqpdist 函数,该函数可以计算序列之间的距离,从而可以用来实现 MK 突变检验。

以下是一段示例代码:

  1. % 定义序列
  2. seq1 = 'ATGAGA';
  3. seq2 = 'ATAGGA';
  4. % 计算距离
  5. distance = seqpdist(char({seq1; seq2}), 'Method', 'Jukes-Cantor');
  6. % 计算 P 值
  7. p = 1 -
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