干货！荧光共定位的散点图解析！_imagej共定位皮尔森系数

作者：凡人多烦事01 | 2024-04-24 03:54:38

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imagej共定位皮尔森系数

荧光共定位定量分析的三大要点。

① 散点图

② 皮尔逊相关系数

③ 重叠系数（也称为共定位系数）

皮尔逊相关系数和重叠系数其实是Image Pro Plus根据散点图进行回归分析计算得到的。

因此，解读散点图成为重中之重，也是发表论文时必须报告出来的。

▼ 1.为什么要分析散点图？

其实最开始定量分析共定位是采用划线法。

IPP把人为划定的线条上的红色通道、绿色通道强度值转换为波形图（如下）。

很快，大家注意到这条人为划定的线不靠谱，线段的位置和长短不同，右侧的波形肯定也会变化。这种局部测量波形图给造假者留下了空间。

于是，散点图出现了。

将整张图中所有荧光点纳入，分离为红色通道和绿色通道，然后根据两个通道的强度（也就是灰度）生成散点图，并计算相关系数。

这样就造不了假，只要图片不变，散点分布是无法被人为操纵。

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