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干货!荧光共定位的散点图解析!_imagej共定位皮尔森系数

imagej共定位皮尔森系数

荧光共定位定量分析的三大要点。

 

① 散点图

② 皮尔逊相关系数

③ 重叠系数(也称为共定位系数)

 

皮尔逊相关系数和重叠系数其实是Image Pro Plus根据散点图进行回归分析计算得到的。

 

因此,解读散点图成为重中之重,也是发表论文时必须报告出来的。

 

 


 

 

▼ 1.为什么要分析散点图?

 

其实最开始定量分析共定位是采用划线法。

 

IPP把人为划定的线条上的红色通道、绿色通道强度值转换为波形图(如下)。

 

 

1.png

 

 

很快,大家注意到这条人为划定的线不靠谱,线段的位置和长短不同,右侧的波形肯定也会变化。这种局部测量波形图给造假者留下了空间。

 

 

于是,散点图出现了。

 

将整张图中所有荧光点纳入,分离为红色通道和绿色通道,然后根据两个通道的强度(也就是灰度)生成散点图,并计算相关系数。

 

这样就造不了假,只要图片不变,散点分布是无法被人为操纵

 

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