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国人“双样本孟德尔随机化”研究论文登二区,IF=11.0

孟德尔随机化分析的时候存在异质性的时候使用ivw-mre是不是就可以了?

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2023年6月5日,中国医学科学院北京协和医学院团队在Aging Cell(IF=11.005)发表题为:Mendelian randomization supports causality between overweight status and accelerated aging的研究论文。

这项研究为一项两样本孟德尔随机化研究,旨在探索超重和衰老替代指标之间的关联。结果表明,超重与加速衰老(端粒长度减少,虚弱指数增加,面部衰老增加)和预期寿命降低间有关。

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摘要与主要结果

一、摘要

背景:据报道,超重可能会导致加速衰老。然而,仍然缺乏关于超重和衰老的因果关系的证据。


方法:我们从全基因组关联研究数据集中收集了与超重、衰老替代指标(端粒长度、虚弱指数和面部衰老)等相关的遗传变异。然后,我们进行了MR分析,探索超重和年龄代理指标之间的关联。MR分析主要采用反方差加权法,随后进行了各种敏感性和验证性分析。


结果:MR分析表明,超重对端粒长度、虚弱指数和面部衰老有明显的关联(β=-0.018, 95%CI=-0.033至-0.003,p=0.0162;β=0.055, 95%CI=0.030-0.079,p<0.0001;β=0.029, 95%CI=0.013-0.046,p=0.0005)。超重与预期寿命也有明显的负因果关系(第90个生存百分位数,β=-0.220,95%CI=-0.323至-0.118,p<0.0001;第99个生存百分位数,β=-0.389,95%CI=-0.652至-0.126,p=0.0038)。此外,研究结果倾向于赞成身体脂肪质量/身体脂肪百分比在衰老替代指标上的因果联系,但不赞成身体无脂肪质量。


结论:这项研究提供了超重与加速衰老(端粒长度减少,虚弱指数增加,面部衰老增加)和预期寿命降低之间的因果关系的证据。因此,需要强调控制体重和治疗超重在对抗加速衰老中的潜在意义。

二、研究结果

1.基线特征

确定了14个与超重相关的全基因组意义的SNPs,并排除了一个弱IV(rs12444979,F=7.99)(表1)。

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2.超重和衰老替代指标

MR分析的主要结果见图1。IVW-FE方法表明,遗传预测性超重对TL、FI和FA有明显的因果关系(β=-0.018,95%CI=-0.033至-0.003,p=0.0162;β=0.055,95%CI=0.030-0.079,p<0.0001;β=0.029,95%CI=0.022-0.037,p<0.0001)。超重与端粒长度减少、FI和FA增加显著相关(图1)。敏感性分析显示,FA的结果存在异质性,但不存在多态性(表2)。进一步采用IVW-MRE方法,表明超重对FA有因果效应(β=0.029,95%CI=0.013-0.046,P=0.0005)。

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3.超重和寿命

MR分析显示,超重对寿命(第90生存百分位数和第99生存百分位数)有明显的因果关系。超重与预期寿命减少有关(第90生存百分位数,β=-0.220,95%CI=-0.323至-0.118,P<0.0001;第99生存百分位数,β=-0.389,95%CI=-0.652至-0.126,P=0.0038)(图2)。敏感性分析显示,不存在异质性和多态性(表2)。

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4.BW、BFM、BFP、BFFM和衰老替代指标

分析结果显示,BFM和BFP对衰老代理指标都有显著的因果关系(BFM对TL:β=-0.057,95%CI=-0.081~-0.033,P<0.0001;BFM对FI:β=0.212,95%CI=0.178~0.246,P<0. 0001;BFM对FA:β=0.048,95%CI=0.035-0.061,P<0.0001;BFP对TL:β=-0.078,95%CI=-0.110至-0.045,P<0。0001;BFP对FI:β = 0.295,95% CI = 0.247-0.343,p < 0.0001;BFP对FA:β = 0.050,95% CI = 0.032-0.069,p < 0.0001)。BW对FI和FA有因果关系(β = 0.145,95% CI = 0.113-0.177,p < 0.0001;β = 0.055,95% CI = 0.043-0.068,p < 0.0001),但对TL没有关系。BFFM仅与FA明显相关(β = 0.056,95% CI = 0.042-0.070,P < 0.0001)。虽然IVW方法显示BFFM和FI之间有因果关系,但MR-Egger方法显示了相反的方向,表明因果关系是无效的。(图3)。

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5.混杂因素分析

通过Phenoscanner对超重相关的SNPs、GWASes和疾病的相关信息进行总结和分析后,我们发现了一些潜在的混杂因素,主要包括物质/能量代谢、性激素、心血管疾病、糖尿病、认知功能障碍、吸烟、饮酒、肾脏疾病、呼吸系统疾病、神经肌肉疾病、自身免疫性疾病和癌症等(图4)。

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6.多变量分析

为了进一步估计超重与衰老替代指标之间的关联,我们进行了多变量的MR分析(图5)。没有一个因素可以调整超重对FI的因果关系,以及超重对FA的因果关系(所有P<0.025)。在一次性调整所有因素后,超重和FA的因果关系仍然显著(P = 0.0001),而超重和FI的关系是提示性的(P = 0.0245)。

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7.中介分析

根据混杂分析和多变量分析的结果,我们分析了HbA1c、CHD和IS对超重和衰老替代指标之间因果关系的中介作用(图6)。结果表明,超重对FI的因果关系可能部分由CHD和IS中介,而超重对FA的因果关系可能部分由HbA1c、CHD和IS中介。具体来说,CHD和IS分别介导了超重和FI之间约12%和11%的影响。而HbA1c、CHD和IS分别介导了超重与FA之间约4%、9%和4%的影响。

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设计与统计学方法

一、研究设计

Data source(数据来源) GWAS数据库和英国生物银行

E(Exposure)暴露因素超重、BW、BFM、BFP、BFFM

O(Outcome)结局衰老替代指标(端粒长度、虚弱指数和面部衰老)、预期寿命

S(Study design)研究类型双样本孟德尔随机化

二、统计方法

1.在R软件中进行分析。

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2.固定效应反方差加权法(IVW-FE)评估了暴露和结果之间的因果关系

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3.还使用了简单中位数简单模型加权模型加权中位数MR EggerMRpleiotropy残差和离群点(MR-PRESSO)方法进行补充分析。

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4.为了验证和调整结果的有效性和稳定性,进行了敏感性分析,其中包括异质性检验(Cochrane's Q检验、MR-PRESSO全局检验)多态性检验(MR Egger截距检验、MR-PRESSO扭曲检验)留一检验

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5.一旦发现异质性(P<0.05),采用乘法随机效应IVW(IVW-MRE)方法来评估因果效应。

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6.使用Phenoscanner V2(http://www.phenoscanner.medschl.cam.ac.uk/)进行混杂分析。

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7.多变量分析采用了IVW方法,Bonferroni校正用于多重比较

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8.使用中介MR分析来验证和分析超重和衰老替代指标之间的关联的中介变量

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