lammps建模_lammps建模专题（2）

结合上期lammps建模专题(1)，我们来举一些实例建模，以帮助大家更好掌握lammps命令建模的方法。

实例一：建立一个简单的bcc模型，平移(0.1 0.1 0.1)个晶格，并将z轴定义为[1 1 1]方向

所建模型用ovito查看如下：

这里有两个事情可以讲一下：

  一是单位问题。用了units metal表示长度单位为埃，然后lattice的scale定为3.14之后，后边的长度比如 origin 0.1 0.1 0.1表示的是0.1个3.14埃。同样的，region命令定义一个名叫box(这个region的ID叫做box)的块(block)，这个块的大小 “0 5 0 5 0 5”表示x y z 方向的始末坐标为“0个3.14埃”到“5个3.14埃”。如果这个脚本没有定义scale的大小(比如直接read_data读取的模型)，那么后边的长度单位还是埃，这点在写续算脚本时容易被忽略。

  二是周期性问题。用这个例子产生的构型用ovito做CNA分析，可知并不是三个方向都满足周期性边界