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一.MATLAB应用软件介绍
MATLAB是一种科学计算软件,专门以矩阵的形式处理数据。MATLAB将高性能的数值计算和可视化集成在一起,并提供了大量的内置函数,从而被广泛地应用于科学计算、控制系统、信息处理等领域的分析、仿真和设计工作,而且利用MATLAB产品的开放式结构,可以非常容易地对MATLAB的功能进行扩充,从而不断深化对问题认识,更多提升MATLAB产品应用范围。
MATLAB产品广泛应用于各个行业,典型应用:
1 数值分析、数值和符号计算、工程与科学绘图
2 控制系统的设计与仿真
3 数字图像处理
4 通讯系统设计与仿真
4 财务与金融工程
二.MATLAB并行计算功能特点与硬件配置分解
随着科学计算的应用面扩大和深入,MATLAB的计算量越来越大,同时基于X86架构计算机多核并行计算技术成熟,MATLAB通过支持并行计算工具箱和分布式集群计算方式,完美借助多核架构的图形工作站和分布式集群的并行计算,大幅提升科学计算的效能。
2.1 MATLAB的并行计算介绍
对工作站的并行计算支持
MATLAB利用 Parallel ComputingToolbox,可以使用多核处理器、GPU 以及计算机集群来解决运算和数据密集型问题。循环并行化 (parallel for-loops)、特殊数组类型以及并行数值算法等高级结构让您实现 MATLAB 应用程序的并行化,而无需进行 CUDA 或 MPI 编程。可以使用 Simulink 工具箱并行运行一个模型的多个仿真。
工具箱提供用于在多核台式机上本地执行应用程序的12个worker(MATLAB 计算引擎)无需更改代码。
对分布式集群并行科学计算支持
借助MATLABDistributed Computing Server在计算机集群或网格计算服务上运行同一个应用程序。此外,还可以交互式执行或在成批执行并行应用程序。
主要功能
循环并行化 (parfor) - 用于在多处理器上并行运行任务的算法
支持启用了 CUDA 的 NVIDIA GPU
可在一个多核桌面上本地运行十二个 worker
通过 MATLAB Distributed Computing Server 可支持计算机集群和网格
并行应用程序的交互和批量执行
分布式数组和单程序多数据 (spmd) 结构 - 用于大型数据集处理和数据并行算法
2.2工作站硬件配置与科学计算分解
矩阵式求解代数方程组过程中,矩阵规模的大小涉及到占用内存的多少,数据量和算法涉及到CPU的核数和频率,数据存储和读取对矩阵存储的硬盘I/O有要求,在很大程度上影响了计算的速度.是加速矩量法计算的关键,典型计算机配置的每一个配件对MATLAB性能有不同表现。
CPU---有更多CPU核心的计算机比和数量少的有更好的表现,但是结果随着MATLAB应用而不同,MATLAB自动使用多线程,在很多MATLAB应用中,以探索自然并行,但是不是所有MATLAB功能都是多线程的, 加速随着算法有所不同, 作为可选能力,Parallel Computing Toolbox提供并行程序结构,更多直接覆盖计算机多核,虚拟核很明显改善整个系统的性能,但是它对MATLAB应用的性能表现影响很小。
内存---内存容量在计算过程承载数据计算过程所有中间数据保存,如果存储容量不够,就会出现数据溢出,计算无法继续,不同数据量的求解对内存有一定要求,内存容量、CPU-内存通道数目、内存的频率都是对计算有影响的。
硬盘---硬盘I/O带宽涉及数据读写和虚拟内存的性能,对于数据密集型计算和大型图像处理,硬盘容量和带宽极其重要。
图卡---目前仅限支持Nvidia CUDA架构为主,MATLAB图形渲染靠的是CPU不是GPU,图卡主要负责正常的图形显示,以及支持GPU架构的并行计算应用,这种GPU并行计算主要是图像处理方面(需要安装ParallelComputing Toolbox)。
2.3工作站配置原则
1.内存配置:通常,矩阵计算的数据量和内存比例1:3,例如2GB数据,内存建议6GB以上。
2. CPU配置:内存确定后,一般和CPU核数比例是 4:1,例如:16GB内存以内,CPU用单颗4核.
3. 图卡配置:如果是基于图像处理应用,最好提供支持1~4块GPU计算,保证足够的数据量。
4. 硬盘配置:对于数据量规模小的应用,SATA接口就可以,如果数据量大,硬盘容量和转速相应提升,读写带宽也就越大,如数据量非常大,可以使用高速硬盘加高性能阵列,提升硬盘I/O带宽。
三.MATLAB科学计算工作站配置方案
Ultralab定制图形工作站是当今市场唯一能提供塔式、超级、机架、便携、特种等图形工作站全方面解决方案的品牌。拥有完整、完美、可靠、静音的高性能工作站全套产品系列,为行业用户在高性能计算、CAD/CAM/CAE、图形图像处理、虚拟仿真、三维动画、视频编辑等应用提供强劲、高效的定制专业级图形工作站。
Ultralab定制图形工作站将MATLAB应用软件结合最新计算机硬件技术,基于数据规模和软件应用特点划分配置方案,从而达到合理高效能完成科学计算。
科学计算工作站根据数据规模划分:
1.小规模科学计算解决方案
定位: 数据量在1~10GB以内规模, 支持4个~8个worker运算
参考配置:
方案1 入门级图形工作站
提供四核CPU架构的计算解决方案
型号 UltraLAB H360/H370
硬件配置规格
No | 类别 | 技术规格 | |
| 机型 | UltraLAB H360 | UltraLAB H370 |
1 | CPU | Intel第七代超高频处理器 (Kabylake架构) 4核4.8~5.2GHz | Intel第八代超高频处理器 (Coffelake架构) 6核4.7~5.0GHz |
2 | 芯片组 | Intel Z270+PCH | Intel Z370+PCH |
3 | 内存槽/ 通道数 最大容量 | 4根/双通道 双通道 64GB DDR4-2400 | 4根 双通道 64GB DDR4-2666 |
4 | 显卡 | 类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡 数量:最大2块, 接口:Pcie 16x 3.0 图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成 | |
5 | 硬盘 | 5.1系统盘 类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB 类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB 5.2数据盘 类型1:SATA,数量5个,最大50TB 类型2:SAS,数量8个,支持32TB | |
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) | |
7 | 平台 | 箱体:塔式(立式) 尺寸:深度553mm,宽度198mm,高度425mm 电源:750w ,金牌 硬盘位:4个3.5”,3个5.25” PCI扩展槽:2*PCIe 16X 3.0,1*PCIe 4X 3.0,3*PCIe 1X 3.0 IO端口:2个USB 3.0,4个USB 2.0,2个USB 3.1 intel千兆以太,8声道音频 前置输出端口:2个USB 2.0 | |
8 | 硬件系统优化 | (1) CPU自动超频加速 (2) 高性能低延迟加速 | |
9 | 扩展能力 | (1) CPU+GPU异构计算架构 (2) 图形生成架构 (3) 系统盘高io、高带宽架构 (4) 高io并行存储架构 | |
10 | 显示器 | 可选,分辨率:高清、2K、4K | |
11 | 操作系统与虚拟系统 | 支持Windows7/8/10个人版 支持Windows Server 2008/2012/2016企业版 支持 Linux 全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等) | |
12 | 噪音控制 | 基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝 |
方案2 高性价比图形工作站
提供8~18核CPU架构的计算解决方案
型号 UltraLAB H490
硬件配置规格:
类别 | 技术规格 | |
1 | CPU | Intel 第七代至尊处理器 (Kabylake-X架构) 数量 1颗,核数4~18个 选择1:8核4.8Ghz , 8MBL2缓存,11MBL3缓存 选择2:10核4.7Ghz, 10MBL2缓存,13.75MBL3缓存 选择3:12核4.6Ghz, 12MBL2缓存,16.5MBL3缓存 选择4:14核4.5Ghz, 14MBL2缓存,19.25MBL3缓存 选择5:16核4.5Ghz, 16MBL2缓存,22MBL3缓存 选择6:18核4.5Ghz, 18MBL2缓存,24.75MBL3缓存 |
2 | 芯片组 | Intel X299+PCH |
3 | 内存槽/ 通道数 最大容量 | 8根 4通道 512GB DDR4-2666 Reg ECC |
4 | 专业图卡 | 类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡 数量:最大5块, 接口:Pcie 16x 3.0 图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成 |
5 | 硬盘 | 5.1系统盘 类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB 类型2:SSD SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB 5.2数据盘 类型1:SATA,数量5个,最大50TB 类型2:SAS,数量8个,支持32TB |
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) |
7 | 平台 | 箱体:塔式(立式) 尺寸: 深度525.3mm,宽度193mm,高度424mm 电源:865w ,金牌 硬盘位:4个3.5”,3个5.25” PCI扩展槽:5*PCIe 16X IO端口:2个USB 3.1G2,6个USB 3.1,intel千兆以太,8声道音频 前置端口:2个USB 2.0 |
8 | 硬件系统优化 | (1) CPU自动超频加速 (2) 高性能低延迟加速 |
9 | 扩展能力 | (1) CPU+GPU异构计算架构 (2) 图形生成架构 (3) 系统盘高io、高带宽架构 (4) 高io并行存储架构 |
10 | 显示器 | 可选,支分辨率:高清、2K、4K |
11 | 操作系统 | 支持Windows7/8/10个人版 支持Windows Server 2008/2012/2016企业版 支持 Linux 全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等) 支持虚拟、私有云、共享图形服务系统 |
12 | 噪音控制 | 基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝 |
2.中等规模科学计算解决方案
定位于数据量在10~30GB以内科学计算规模, 支持8个~12个worker运算,支持GPU架构扩展
参考配置:
方案3 全能型图形工作站
提供20~56核CPU架构的计算解决方案
型号 UltraLAB EX620i
产品配置规格
No | 类别 | 技术规格 |
1 | CPU | 型号:Xeon可扩展处理器系列 数量 2颗,核数20~56个 |
2 | 芯片组 | Intel C621+PCH |
3 | 内存槽/ 通道数 最大容量 | 16根 12通道 1TB DDR4-2666 Reg ECC |
4 | 专业图卡 | 类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡 数量:最大4块, 接口:Pcie 16x 3.0 图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成 |
5 | 硬盘 | 5.1系统盘 类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB 类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB 5.2数据盘 类型1:SATA,数量8个,最大80TB 类型2:SSD,数量8个,支持32TB |
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) |
7 | 平台 | 箱体:塔式、机架式两用 尺寸:深度648mm,宽度178mm,高度452mm 电源:1200w,金牌 硬盘位:8个3.5”热插拔,3个5.25” PCI扩展槽:4*PCIe 16X,2*PCIe 8x IO端口:2个USB 3.1,4个USB 3.1,2个USB 3.0,双intel千兆以太,8声道音频 前置端口:2个USB 2.0 |
8 | 硬件系统优化 | (1) CPU自动超频加速 (2) 高性能低延迟加速 (3) 高IO并行存储加速 |
9 | 扩展能力 | (1) CPU+GPU异构计算架构 (2) 系统盘高io、高带宽架构 |
10 | 显示器 | 可选,支持分辨率:高清、2K、4K |
11 | 操作系统 | 支持Windows 7/8/10个人版 支持Windows Server 2008/2012/2016企业版 支持 Linux全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等) 支持虚拟、私有云、共享图形服务系统 |
12 | 噪音控制 | 基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝 |
方案4 图形图像型工作站
提供基于CPU+GPU架构的计算解决方案
型号 UltraLAB H610
产品配置规格
配备2颗最新intel Haswell架构的Xeon E5 2600v4处理器、Nvidia 图卡、高I/O的企业级SSD,提供多种pcie 3.0 16x/8x/4x接口,配置规格:
No | 类别 | 规格 | |||||
1 | CPU | 2颗Xeon E5 2600v4系列(Broadwell-EP核心,最大44核) 支持自动超频加速, 最高频率达3.68Ghz | |||||
2 | 芯片组 | Intel C612+PCH Chipset | |||||
3 | 内存 | 内存槽/最大容量:16根/512GB DDR4 2400 Reg ECC | |||||
4 | 硬盘 | 系统盘:M.2 4X接口,最大容量512GB, | |||||
5 | 专业图卡 | Nvidia Quadro 或ATI Firepro全系列 | |||||
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) | |||||
7 | 网络端口 | 双千兆intel芯片,支持IO/AT加速,支持汇聚功能 | |||||
8 | 扩展接口 | 分类 | PCIe 16X 3.0 | PCIe 8X 3.0 | PCIe 4X 2.0 | PCI-X | PCI |
3 | 2 | 1 | |||||
9 | 机箱电源 | 塔式,900W | |||||
10 | 显示器 | 可选 | |||||
12 | 操作系统 | 支持Windows 2008、2012, Window7、8 32/64bits 支持 Redhat linux, Suse Linux 32/64bits等等 |
3.大规模科学计算解决方案
定位于数据量在30~70GB以内科学计算规模, 支持12个worker运算,支持双GPU架构并行计算扩展,配备海量高速硬盘。
参考配置:
方案5 超级图形工作站
提供基于超强CPU+GPU+高I/O的计算解决方案
型号 UltraLAB Alpha720
Alpha720完美满足需要超多CPU核数、海量内存架构的高性能计算应用,为超大规模科学计算、有限元仿真、分子模拟计算、海量图像处理、大数据挖掘与分析、共享图形服务器系统等高端应用,海量数据级的超大规模科学与工程仿真、图像处理的超级图形工作站,同时具有绿色环境要求的静音、低辐射。
产品配置规格
No | 类别 | 技术规格 |
1 | CPU | Xeon E7 v3/ v4系列 数量 4颗,核数64、72个、96个, 支持CPU自动睿频加速, 最高频率达2.9Ghz 最高浮点计算速度3.8Tflops |
2 | 芯片组 | Intel C602J+PCH(双QPI架构) |
3 | 内存槽/ 通道数 最大容量 | 32根 16通道 2TB DDR4-2133 Reg ECC |
4 | 专业图卡 | 类型:专业图卡、游戏卡、GPU超算卡 数量:最大2块, 接口:Pcie 16x 3.0 图形功能:支持图形生成加速、mosaic合成 |
5 | 硬盘 | 5.1系统盘 类型1:M.2 SSD,PCIe 4x接口,单盘最大容量2TB 类型2:SSD,SATA 6Gbps接口,单盘最大容量4TB 5.2数据盘 类型1:SATA,数量16个,最大160TB 类型2:SSD,数量16个,支持64TB |
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) |
7 | 平台 | 箱体:双塔式 尺寸:深度572mm,宽度405mm,高度628mm 电源:1700w,金牌 硬盘位:16个3.5”,3个5.25” PCI扩展槽:2*PCIe 16X,2*PCIe 8x IO端口:前置输出:4个USB 2.0,后置输出:3个USB 2.0,双intel千兆以太,8声道音频 |
8 | 硬件系统优化 | (1) CPU自动超频加速 (2) 高性能低延迟加速 (3) 高IO并行存储加速 |
9 | 扩展能力 | (1) CPU+GPU异构计算架构 (2) 系统盘高io、高带宽架构 |
10 | 显示器 | 可选,支持分辨率:高清、2K、4K |
11 | 操作系统 | 支持Windows 7/8/10个人版 支持Windows Server 2008/2012/2016企业版 支持 Linux全系列(Redhat、Ubuntu、Centos等) 支持虚拟、私有云、共享图形服务系统 |
12 | 噪音控制 | 基于办公环境,满负荷计算,噪音低于45分贝 |
4. 超大规模科学计算解决方案
定位:数据量在100GB以上科学计算规模
参考配置:
方案6 超级科学与工程计算工作站
四颗Xeon E7 v4(最高96核、192线程)处理器、双GPU超算、双通道高速并行存储
配置规格
No | 类别 | 技术规格 | |||||
1 | CPU | 4颗Xeon E7 v3/v4系列(最高96核) | |||||
2 | 芯片组 | Intel C602J+PCH Chipset | |||||
3 | 内存 | 内存槽:32根 最大容量:2TB DDR4 1866 Reg ECC | |||||
4 | 系统盘 | 系统盘:SATA-SSD 6Gbps或Pcie 4x接口,最大容量2TB | |||||
| 数据盘 | 海量高速并行存储系统(16个3.5”盘位,最大200TB,RAID5冗余) | |||||
5 | 专业图卡 | 专业图形显卡、GPU超算卡 | |||||
6 | 光驱 | DVD(刻录机)或蓝光DVD(刻录机) | |||||
7 | 网络端口 | 双intel千兆/万兆以太芯片,支持IO/AT加速,支持汇聚功能 | |||||
8 | 扩展接口 | 分类 | PCIe 16X 3.0 | PCIe 8X 3.0 | PCIe 4X | PCI-X | PCI |
| 2 | 2 |
|
|
| ||
9 | 机箱电源 | 双塔式,1700W ,静音级 | |||||
10 | 显示器 | 可选 | |||||
11 | 键盘鼠标 | 可选 | |||||
12 | 操作系统 | 支持Windows 2008 /2012 64bits 支持 Redhat linux, Suse Linux 64bits等等 |
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